第一篇:實驗二 植物核酸的提取-教案
授課教師 學生人數 55 課 題 實驗二 植物基因組DNA的提取 授課類型 新授課 授課方法 講授、演示 教學目的 掌握CTAB法提取植物基因組DNA的原理與方法 教學重點 理解每一步實驗操作的目的 教學難點 實驗操作過程中的一些注意事項 教學過程
一、背景知識
1.DNA在細胞中存在的位臵?植物細胞DNA存在的位臵和動物細胞有何不同?(圖)教學用具 多媒體
2.DNA的存在形式
雙螺旋結構圖
雙螺旋結構組成
染色體是怎樣形成的?
一級結構(核小體=雙螺旋+組蛋白)-二級結構(螺線管)-三級結構(超螺線管)-四級結構(染色體)
真核生物基因組DNA是經過四級包裝形成了染色體,先是DNA形成雙螺旋結構,再與組蛋白形成核小體(一級結構),壓縮7倍,再形成螺旋管(二級結構),壓縮6倍,之后再形成超螺旋管(三級結構),壓縮40倍,最后超螺旋管壓縮形成染色體(四級結構),再壓縮5倍,正常細胞中基因組DNA是以染色質(相當于一級結構)形式存在,在細胞分裂的中期以染色體形式存在,真核生物細胞質DNA主要是以裸露的環狀DNA形式存在,沒有核小體結構。
3.遺傳物質核酸除了DNA外還有另外一種,即RNA,它與DNA在結構上的區別?(圖)
RNA基本單位中間的五碳糖是核糖,含氮堿基尿嘧啶(U)替代 胸腺嘧啶(T)4.核酸的理化性質
(1)形狀:DNA為白色類似石棉樣的纖維狀物,RNA的純品呈白色粉末或結晶。
(2)溶解性:一般都溶于水,不溶于乙醇、異丙醇、氯仿等有機溶劑,它們的鈉鹽比游離酸易溶于水。(3)保存:在酸性溶液中,核酸易水解,中性或弱堿性溶液中較穩定。
二、實驗目的
1.掌握CTAB法提取植物基因組DNA的原理 2.CTAB法提取植物基因組DNA的實驗方法
三、實驗原理
1.核酸在細胞中的存在方式,是以核酸-蛋白質復合物的形式存在,如一級結構核小體(圖):DNA螺旋+組蛋白
2.通過低溫研缽破壞植物細胞壁
3.加入CTAB溶解細胞膜,CTAB與核酸形成核酸-CTAB復合物,使核酸與蛋白質分離。
4.加入高鹽溶液溶解核酸-CTAB復合物,加入蛋白質變性劑使蛋白質變性沉淀出來,離心除去蛋白質。5.加入核酸沉淀劑,溶解CTAB,并使和核酸沉淀出來,離心得到核酸沉淀。
四、實驗儀器 1.水浴鍋
2.離心機(12管):3臺 3.研缽:10個
4.移液槍(包括槍頭):1ml、400ul
五、實驗材料與藥品
實驗材料:新鮮菠菜葉片 1.十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)
作用:溶解細胞膜并與核酸結合,便于分離核酸。商品信息:瓶裝/100g。
理化性質:白色或淺黃色結晶體至粉末狀,有刺激氣味,易溶于異丙醇,可溶于水,震蕩時產生大量泡沫,化學穩定性好,耐熱、耐光、耐壓、耐強酸強堿。有吸濕性,在酸性溶液中穩定;溶于10份水,溶于熱水、乙醇、三氯甲烷,易溶于異丙醇水溶液,微溶于丙酮,不溶于乙醚和苯。
儲存:在陰涼,干燥,通風良好的地方,遠離不相容的物質。危害:高毒,對皮膚及粘膜刺激性小,有輕微脫脂作用。2.1M Tris-HCl PH8.0緩沖液
作用:提供一個緩沖環境,防止核酸被破壞 商品信息:瓶/100ml,無色、澄清溶液
理化性質:Tris中文品名為三羥甲基氨基甲烷,瓶/500g。是一種白色結晶或粉末。溶于乙醇和水,微溶于乙酸乙酯、苯,不溶于乙醚、四氯化碳,對銅、鋁有腐蝕作用,有刺激性的化學物質。
儲存:室溫保存。
危害:毒性低,可致癌,不要直接接觸皮膚。3.乙二胺四乙酸二鈉(EDTA-2Na)
作用:螯合Mg2+或Mn2+離子,抑制脫氧核糖核酸酶(DNase)活性,活性依賴于鈣離子,并能被鎂離子或二價錳離子激活。
商品信息:瓶/250g。
理化性質:無味無臭或微咸的白色或乳白色結晶或顆粒狀粉末。溶于水,不溶于乙醇、乙醚,其水溶液pH值約為5.3。可由EDTA與氫氧化鈉和碳酸鈣作用制得。
儲存:于陰涼、通風的庫房。遠離火種、熱源。應與氧化劑分開存放,切忌混儲。配備相應品種和數量的消防器材。儲區應備有合適的材料收容泄漏物。
危害:對粘膜和上呼吸道有刺激作用。對眼睛、皮膚有刺激作用。本品可燃,具刺激性。4.Tris飽和酚
作用:強蛋白質變性劑。商品信息:瓶/250ml。
理化性質:為淺黃色透明液體,上層為Tris-HCl溶液,加有抗氧化的0.25% 8-羥基喹啉和0.1%的β-巰基乙醇。
儲存:4℃避光保存。
危害:Tris飽和酚有較強的腐蝕性,應盡量避免皮膚直接接觸或吸入體內。如發現變為黃色或棕色,表明發生氧化,不能使用。5.β-巰基乙醇(2-巰基乙醇)
作用:提供一種還原劑,這樣酚類物質(植物材料特別是老的材料中含有大量的酚類物質)就不能被氧化成醌(醌易與DNA發生共價結合,使DNA發生褐變,從而影響你提DNA的實驗)。巰基乙醇兼有消除CTAB震蕩時產生的泡沫的作用。
商品信息:瓶/100g。
理化性質:無色透明液體,具有少許硫醇氣味。易溶于水,乙醇和乙醚等有機溶劑,與苯可以任意比例混溶。水中溶解度:1mg/mL。
儲存:對空氣敏感,易吸潮。使容器保持密閉,儲存在陰涼、干燥通風處。打開了的容器必須仔細重新封口并保持豎放位臵以防止泄漏。建議貯存溫度 2-8℃。
危害:高毒吸入、攝入或經皮膚吸收后會中毒。對環境有危害,對水體可造成污染。本品可燃。6.氯化鈉(NaCl)
作用:CTAB-核酸復合物在高鹽溶液中易溶。商品信息:瓶/500g,分析純AR。
理化性質:白色晶體狀。易溶于水、甘油,微溶于乙醇、液氨;不溶于濃鹽酸。在空氣中微有潮解性。穩定性比較好。
儲存:儲存于陰涼、通風的庫房。遠離火種、熱源。應與氧化劑分開存放,切忌混儲。危害: 7.無水乙醇
作用:DNA沉淀劑、洗滌劑。商品信息:瓶/500ml,分析純AR。
理化性質:無色澄清液體。極易從空氣中吸收水分,能與水和氯仿、乙醚等多種有機溶劑以任意比例互溶。儲存:儲存于陰涼、通風的庫房。遠離火種、熱源。庫溫不宜超過30℃。保持容器密封。應與氧化劑、酸類、堿金屬、胺類等分開存放,切忌混儲。采用防爆型照明、通風設施。禁止使用易產生火花的機械設備和工具。
危害:易燃,具刺激性。蒸氣與空氣能形成爆炸性混合物,爆炸極限3.5%~18.0%(體積)。8.氯仿(三氯甲烷)
作用:蛋白質變性劑,加速有機相與液相分層,去除核酸溶液中的少量酚(酚易溶于氯仿)。商品信息:瓶/500ml。
理化性質:無色透明液體,極易揮發,有特殊氣味。不溶于水,溶于醇、醚、苯。儲存:保存在密封的棕色瓶中。
危害:麻醉性。有致癌可能性。在光照下遇空氣逐漸被氧化生成劇毒的光氣。9.異戊醇
作用:減少蛋白質變性操作過程中產生的氣泡。異戊醇可以降低表面張力,從而減少氣泡產生。另外,異戊醇有助于分相,使離心后的上層含DNA的水相、中間的變性蛋白相及下層有機溶劑相維持穩定。
商品信息:瓶/500ml。
理化性質:無色液體,有不愉快的氣味。微溶于水,可混溶于醇、醚等有機溶劑。
儲存:儲存于陰涼、通風的庫房。遠離火種、熱源。庫溫不宜超過30℃。保持容器密封。應與氧化劑、酸類等分開存放,切忌混儲。采用防爆型照明、通風設施。禁止使用易產生火花的機械設備和工具。儲區應備有泄漏應急處理設備和合適的收容材料。
危害:吸入、口服或經皮膚吸收有麻醉作用。其蒸氣或霧對眼睛、皮膚、粘膜和呼吸道有刺激作用,可引起神經系統功能紊亂,長時間接觸有麻醉作用。易燃,其蒸氣與空氣可形成爆炸性混合物,遇明火、高熱能引起燃燒爆炸。10.異丙醇
作用:DNA沉淀劑,DNA在異丙醇的溶解度更低,所以用異丙醇來沉淀更完全,而后由于異丙醇不易揮發,所以用乙醇洗去異丙醇,乙醇揮發快。用-20度預冷異丙醇沉淀效果較等體積乙醇沉淀好;異丙醇約和2.5倍體積的乙醇效果相當;但DNA微溶于乙醇,使用乙醇沉淀會使部分DNA溶解損失;所以多選用-20度預冷異丙醇。一般6500倍到8000倍重力10分鐘就可以將異丙醇沉淀的核酸緊密的離到管底。
商品信息:棕色玻璃瓶/500ml。
理化性質:無色透明具有乙醇氣味的可燃性液體。有似乙醇和丙酮混合物的氣味,能與醇、醚、氯仿和水混溶,不溶于鹽溶液。
儲存:儲存于陰涼、通風的庫房。遠離火種、熱源。庫溫不宜超過30℃。保持容器密封。應與氧化劑、酸類、鹵素等分開存放,切忌混儲。采用防爆型照明、通風設施。禁止使用易產生火花的機械設備和工具。儲區應備有泄漏應急處理設備和合適的收容材料。
危害:微毒類,高濃度蒸氣具有明顯麻醉作用,對眼、呼吸道的黏膜有刺激作用,能損傷視網膜及視神經。常溫下可引火燃燒,其蒸汽與空氣混合易形成爆炸混合物。11.PVP-40(聚乙烯吡咯烷酮)
作用:PVP是酚的絡合物,能與多酚形成一種不溶的絡合物質,有效去除多酚,減少DNA中酚的污染;同時它也能和多糖結合,有效去除多糖。
商品信息:白色塑料瓶/100g。
理化性質:白色或乳白色粉末或顆粒,有微臭。溶于水、堿、酸及極性有機溶劑。儲存:室溫干燥保存。危害: 12.液氮(LN2)
作用:低溫導致植物組織凍裂,方便研磨使細胞破碎,使DNA釋放完全;低溫情況下各酶處于低活性狀態,有利于抑制DNAase的作用,保護DNA。商品信息:分析純
理化性質:-196℃。液態的氮氣。是惰性的,無色,無臭,無腐蝕性,不可燃,溫度極低。儲存:儲存于陰涼、通風的庫房。庫溫不宜超過30℃。危害:汽化時大量吸熱接觸造成凍傷。
六、實驗試劑
1.氯仿-異戊醇(24:1)100ml-20ml=80ml {氯仿 96ml + 異戊醇 4ml} = 100ml,4℃保存 2.酚-氯仿-異戊醇(25:24:1)40ml {氯仿-異戊醇(24:1)20ml + Tris飽和酚20ml} = 40ml,4℃保存 3.TE緩沖液 PH8.0 50ml {10mM Tris-HCl(PH8.0)緩沖液 0.5ml + 0.5M EDTA(PH8.0)0.1ml} → → 定容到50ml → 高壓滅菌后冷卻4℃保存 ? 【0.5M EDTA(PH8.0)】的配制:100ml {蒸餾水 80ml + EDTA-2Na.2H2O 18.61g} → 用NaOH(約2g)調至PH8.0 → 定容至100ml → → 分裝后高壓滅菌備用。注:需加入NaOH調至PH8.0才能完全溶解。? 【10mM Tris-HCl(PH8.0)緩沖液】的配制:10ml {1M Tris-HCl PH8.0緩沖液100μl + 水9.9ml} → 定容至10ml → 10mM Tris-HCl(PH8.0)緩沖液 4.2%CTAB抽提液 250ml
{CTAB 4g + 無水乙醇 5ml + 水100ml} → 加入200ml燒杯中 → 加熱溶解 → 再依次加入 → → {5M NaCl 56ml + 1M Tris-HCl(PH8.0)20ml + 0.5M EDTA 8ml} → 定容至250ml → 高壓滅菌冷卻后加入 → {1%β-巰基乙醇(400ul)2ml + PVP-40 5g} → 4℃保存 ? ? 【5M NaCl溶液】配制:100ml {NaCl 29.22g + 水90ml} → 加熱到80℃溶解冷卻后 → 定容至100ml → 高壓滅菌備用 【1%(v/v)β-巰基乙醇】配制:10ml {β-巰基乙醇 100μl +水9.9ml} → 1%β-巰基乙醇10ml 5.蒸餾水
所有藥劑用水都要純凈水經高壓滅菌冷卻
七、實驗步驟
(一)實驗前準備
1.研缽、異丙醇-20℃預冷;【研缽10個、異丙醇75ml】
2.將2%CTAB抽提液從4℃冰箱內取出在65℃水浴預熱;【CTAB抽提液30ml】 3.稱取30份新鮮菠菜葉片,每份1g,稱重時去葉脈;【菠菜葉片30g】 4.用蒸餾水沖洗葉片,濾紙吸干水分,將葉片用剪刀剪小。【洗瓶、濾紙、剪刀】
5.實驗器材:冰箱、65℃水浴鍋、液氮、10ml離心管90個、藥匙、移液槍(1ml、100μl、400μl)、離心機(10000r/min)
6.實驗藥劑:酚-氯仿-異戊醇30ml(每管1ml)、氯仿-異戊醇60ml(每管2ml)、無水乙醇12ml(每管400 μl)、TE緩沖液3ml(每管100μl)
(二)破碎細胞,釋放溶解核酸
1.將葉片臵于預冷的研缽(實驗前-20℃預冷)中,倒入液氮,盡快研磨成粉末;
? 目的:低溫導致植物組織凍裂,方便研磨使細胞破碎,使DNA釋放完全;低溫情況下各酶處于低活性狀態,有利于抑制DNase的作用,保護DNA。
2.將粉末加入10ml離心管中,加入 1ml預熱的CTAB 抽提緩沖液,輕輕攪動搖勻; ? 目的:CTAB可以溶解細胞膜并與DNA結合,便于分離DNA。加入β-巰基乙醇和PVP-40的目的是減少植物中酚類物質的影響。EDTA的作用是螯合Mg2+或Mn2+離子,抑制脫氧核糖核酸酶(DNase)活性,活性依賴于鈣離子,并能被鎂離子或二價錳離子激活。Tris-HCl提供一個緩沖環境,防止DNA被破壞。高鹽溶液可以更好的溶解核酸-CTAB復合物。
3.將離心管臵于 65℃的水浴中保溫40分鐘,期間每隔10分鐘輕輕搖晃幾次。? 目的:水浴使CTAB抽提液和葉片充分反應。
(三)抽提去掉蛋白質
1.將水浴的離心管取出,冷卻 2分鐘后,加入1ml酚-氯仿-異戊醇,振蕩 2分鐘,使兩者混合均勻,12000 r/min離心10分鐘; ? 目的:第一次離心溶液分3層,上-中-下層:CTAB-核酸-變性蛋白-有機溶劑
2.取上清液(含CTAB-核酸)至新的10 ml離心管中,加入2ml氯仿-異戊醇,輕輕顛倒離心管,混勻,12 000r/min離心10分鐘。? 目的:第二次離心進一步去掉變性蛋白,去掉多余的酚
(四)沉淀核酸
1.小心取上清液(含CTAB-核酸)臵于一個新的10ml離心管中(盡量避免吸取中間層),加入2.5ml的異丙醇(-20℃預冷),將離心管慢慢上下搖動30秒,使異丙醇與水層充分混合,室溫放臵15分鐘至能見到DNA絮狀物; ? 目的:異丙醇為DNA沉淀劑,異丙醇與CTAB互溶,但不與核酸相溶。用-20℃預冷的異丙醇沉淀效果較等體積乙醇沉淀好,異丙醇約和2.5倍體積的乙醇效果相當,但核酸微溶于乙醇,使用乙醇沉淀會使部分核酸溶解損失;所以多選用-20度預冷異丙醇。核酸在異丙醇的溶解度更低,所以用異丙醇來沉淀更完全。異丙醇易溶于CTAB,但不與核酸相溶。2.10000r/min離心10分鐘,小心倒去上清液。? 目的:第三次離心使核酸沉淀到管底。
(五)核酸的洗滌
用400ul無水乙醇洗滌核酸沉淀直至無色,10000r/min離心10分鐘,傾去上清液晾干。? 目的:異丙醇不易揮發,所以用乙醇洗去異丙醇及多余的NaCl,乙醇揮發快。
(六)保存
向下層離心物中加入100μl TE緩沖液進行溶解,臵于-20℃冰箱保存,以便下次課用。? 目的:一般長期保存DNA,貯存在TE緩沖液中比較好。TE為含EDTA的Tris-HCl(PH 8.0)緩沖液:其中比較關鍵的成分是EDTA,日常環境中不可避免的存在DNase,而DNase的活性依賴于鈣離子,并能被鎂離子或二價錳離子激活。鎂離子存在條件下,DNase I可隨機剪切雙鏈DNA的任意位點;二價錳離子存在條件下,DNase I可在同一位點剪切DNA雙鏈,形成平末端,或1-2個核苷酸突出的粘末端。TE中含有的EDTA可以螯合金屬離子,從而使DNase失活。而Tris-HCl的作用主要是維持一定堿性PH值,有助于DNA的溶解和穩定。不加EDTA也是可以的,而且EDTA會影響下游酶切,連接反應以及質粒轉染進細胞的效率,如果接下來要做這些實驗是應該避免使用含EDTA的緩沖液的。短期儲存DNA也可以使用ddH2O,有助于DNA連接等效果。
八、實驗注意事項
1.在整個實驗過程中應嚴格執行無菌操作; 2.部分藥品有毒,操作中應注意安全防護;
3.磨樣時最好是加液氮,磨樣速度要快,使材料處于低溫狀態; 4.剛投入水浴時可以稍快速的晃動,之后的晃動一定要輕柔; 5.抽提時不要有太力振動,操作也要仔細,盡量避免DNA斷裂;
6.將異丙醇吸出時用的槍頭一定要剪過的,這點很重要,過尖的槍頭會把DNA鏈弄斷。
九、思考題
1.本實驗中用到的各種試劑的作用是什么? 2.本實驗中進行了幾次離心操作,每次的目的?
十、實驗安排
全班55人,按照學號分組,每6人一組,共9組,最后一組7人。每組作3個離心管,共用一個研缽。
每3組(共18人9個離心管)共同進行離心操作。
第二篇:實驗四 植物DNA的提取[定稿]
實驗四
植物DNA的提取
一、實驗目的
掌握CTAB法從植物葉片提取DNA的原理和方法。采用CTAB法從植物葉片中提取基因組DNA,并進行純度分析。
二、實驗原理
1、核酸提取的基本原理
核酸是生物有機體中的重要成分,在生物體中核酸常與蛋白質結合在一起,以核蛋白的形式存在。核酸分為脫氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)兩大類,在真核細胞中,前者主要存在于細胞核中,后者主要存在于細胞質及核仁里。在制備核酸時,通過研磨破壞細胞壁和細胞膜,使核蛋白被釋放出來。
在濃氯化鈉溶液(1~2 mol/L)中,DNA核蛋白的溶解度很大,RNA核蛋白的溶解度很?。欢谙÷然c溶液(0.14 mol/L)中,DNA核蛋白的溶解度很小,RNA核蛋白的溶解度很大。因此,可利用不同濃度的氯化鈉溶液將DNA核蛋白和RNA核蛋白從樣品中分別抽提出來。分離得到核蛋白后,需進一步將蛋白等雜質除去,常采用的去除蛋白的方法有3種:①用含異戊醇的氯仿振蕩核蛋白溶液,使其乳化,然后離心除去變性蛋白質,此時蛋白質凝膠停留在水相和氯仿相中間,而DNA溶于上層水相。用兩倍體積的無水乙醇溶液將DNA鈉鹽沉淀出來。如果用酸性乙醇或冰乙酸來沉淀,得到的是游離的DNA。②用十二烷基硫酸鈉(SDS)等去污劑使蛋白質變性,與核酸分離,從而從材料中直接提取出DNA。③用苯酚處理,然后離心分層,DNA溶于上層水相,蛋白變性后則停留在酚層內。吸出上面水層,加兩倍體積的無水乙醇溶液,得到白色纖維狀DNA沉淀。反復使用上述方法多次處理DNA核蛋白溶液,就能將蛋白等雜質較徹底地除去,得到較純的DNA制品。為了徹底除去DNA制品中混雜的RNA,可用RNA酶處理。生物材料中含有的脂肪物質和大部分的多糖,在用鹽溶液分離核蛋白和用乙醇或異丙醇分級沉淀時即被除去。
在DNA提取、制備的過程中,核酸極不穩定,許多因素可破壞其完整結構:①化學因素,核酸的結構在pH值4.0~11.0間較穩定,pH值在此范圍外就會使核酸變性降解,故制備過程應避免過酸過堿。②物理因素,DNA分子鏈很長,是雙螺旋結構,既有一定的柔性,又有一定的剛性,故強機械作用如劇烈攪拌會令DNA分子斷裂,不利于收集,應加以避免。③酶的作用,細胞中普遍存在的核酸酶在細胞壁或膜遭到破壞時被釋放出來,它會降解DNA分子。故須用酶的變性劑、抑制劑使之失活。操作過程最好在低溫(0℃左右)下進行。常用的酶抑制劑有檸檬酸鹽、氟化物、砷酸鹽、乙二胺四乙酸鹽、(ETDA-Na)等。SDS和苯酚作為蛋白變性劑,同時可使核酸酶被破壞而失活。
2、CTAB法和SDS法的提取原理
(1)CTAB法是一種快速簡便的提取植物總DNA的方法.。CTAB(十六烷基三甲基溴化銨)是一種陽離子型去污劑,它不僅能使蛋白質變性,而且還能與核酸形成特異的核酸-CTAB復合物,這種復合物溶于高鹽緩沖液(≥0.7M NaCl),降低鹽濃度,通過超速離心能選擇性地沉淀核酸,并與多糖等可溶性雜質分開,CTAB-核酸復合物再用70-75%乙醇浸泡可脫掉CTAB。提取時先將新鮮的葉片在液氮中研磨,破碎其細胞,然后加入CTAB分離緩沖液,將DNA溶解出來,再經氯仿-異戊醇抽提除去蛋白質,最后通過異丙醇沉淀或低鹽離心得到DNA。
(2)SDS法也是提取植物DNA的常用方法。先將新鮮的葉片在液氮中研磨以機械力破本碎細胞壁,然后加入SDS使細胞膜破裂,并同時將蛋白質和多糖等雜質與核酸分開。加入KAc可使SDS—蛋白質復合物轉變為溶解度更小的鉀鹽形式,使沉淀更加完全。
3、DNA的濃度測定和純度分析
(1)定磷法:是對樣品中核酸(DNA和RNA)含量的準確定量。將樣品中的核酸用強酸(硫酸或高氯酸)消化成無機磷,然后用定磷試劑對生成的無機磷酸進行滴定。定磷試劑是酸性鉬酸銨溶液,鉬酸銨能與無機磷酸定量結合成磷鉬酸絡合物,該絡合物能被抗壞血酸等還原劑還原成蘭色的鉬藍,在660nm處有最大光吸收。
(2)紫外光吸收法:核酸及其衍生物的紫外吸收高峰在260nm。1ug/mL的DNA溶液A260=0.020,1ug/mL的RNA溶液或單鏈DNA的A260=0.022~0.024。1個A260相當于50ug/mL的DNA、40ug/mL的RNA。蛋白質的最大吸收在280nm,多糖的最大吸收在230nm。純的DNA的A260/A280在1.8左右,純的RNA的A260/A280在2.0左右。
三、試劑和器材:
(1)1M Tris-cl(pH8.0):Tris l21.1g溶于蒸餾水,用濃HCl調至pH8.0以蒸餾水定容至1000ml(2)CTAB分離緩沖液: 2g CTAB,8.18g NaCL,0.74g EDTA.Na2.2H2O,10mL 1mol/L的Tris-HCL(pH8.0),0.2mL巰基乙醇,加水定容到100mL。
(3)洗滌緩沖液(70%乙醇,10mmol/L乙酸銨):70mL無水乙醇,0.077g乙酸銨,加水到100mL。(4)TE緩沖液:10mmol/L Tris-HCL(pH7.4),1mmol/L EDTA(5)氯仿:異戊醇=24:1(6)液氮
(7)研缽,恒溫水?。?7~100℃),離心機,離心管。
四、操作方法:
(1)將10mlCTAB分離緩沖液加入50ml離心管中,置于65℃水浴中預熱。(2)稱取1.5g葉片,置于預冷的研缽中,倒入液氮,盡快將葉片研碎。(3)取1g粉末直接加入預熱的CTAB分離緩沖液中,輕輕轉動使之混勻。
(4)樣品于65℃保溫30分鐘,每5~10分鐘混勻一次。(5)加等體積(10ml)的氯仿-異戊醇,輕輕顛倒混勻。(6)室溫下4000r/min離心10分鐘。
(7)用膠頭滴管將上層水相吸入另一干凈的離心管中(注意不要吸動懸浮的細胞碎片和中間白色的蛋白質層),向離心管中加入2/3體積的異丙醇,輕輕混勻,使DNA析出。(有些情況下,這一步可以產生云霧狀的DNA析出,如果看不到云霧狀的DNA,樣品則可以在冰浴中放置數小時甚至過夜)。(8)用下述方法收集DNA:
如果呈云霧狀的DNA析出,則用玻璃棒在云霧狀的DNA中輕輕轉動,纏起DNA,然后將玻璃棒轉移至20mL洗滌緩沖液中浸泡洗滌10分鐘(不要將DNA沉淀從玻璃棒上弄掉)。
如果看不到云霧狀的DNA,可將離心管在4000r/min離心5分鐘,小心地倒掉上清液,在松散的沉淀上加20mL洗滌緩沖液,輕輕轉動離心管,洗滌核酸沉淀10分鐘,然后離心,小心地倒掉上清液,讓DNA沉淀自然干燥20分鐘。(9)用玻璃棒纏出DNA,在室溫下使DNA自然干燥20分鐘。(10)
將自然干燥的DNA溶于1mLTE緩沖液中,—20℃保存備用。
(11)
取100uL稀釋20倍,測定A260,A280,A230,或作出吸收波譜200~400nm并計算濃度和得率。
(12)
取5~10uLDNA溶液做0.7%的瓊脂糖電泳,檢查DNA的大小和質量,以λ-DNA/HindⅢ做分子量標準,另取5uL做限制性酶切。
注意;所有操作均須溫和,避免劇烈震蕩。
五、思考題
1、CTAB、EDTA、巰基乙醇的作用是什么?
2、吸取樣品、抽提、及電泳時應注意什么?為什么?
第三篇:幾種核酸提取方法概述
幾種核酸提取方法概述
(1).濃鹽法
利用RNP和DNP在電解溶液中溶解度不同,將二者分離,常用的方法是用1M 氯 納提取化鈉抽提,得到的DNP粘液與含有少量辛醇的 氯仿一起搖蕩,使乳化,再離心除去蛋白質,此時蛋白質凝膠停留在水相及氯仿相中間,而DNA位于上層水相中,用2倍體積95%乙醇可將DNA 鈉鹽沉淀出來.也可用0.15 MNaCL液反復洗滌細胞破碎液除去RNP,再以1MNaCL提取脫氧核糖蛋白,再按氯仿---異醇法除去蛋白.兩種方法比較,后種方法使核酸降解可能少一些.以稀鹽酸溶液提取DNA 時,加入適量去污劑,如SDS可有助于蛋白質與DNA 的分離。在提取過程中為抑制組織中的DNase對DNA 的降解作用,在氯化鈉溶液中加入檸檬酸鈉作為金屬離子的烙合劑.通常用.15MNaCL,0.015M檸檬鈉,并稱SSC溶液,提取DNA.(2).陰離子去污劑法:
用SDS或二甲苯酸鈉等去污劑使蛋白質變性,可以直接從生物材料中提取DNA.由于細胞中DNA與蛋白質之間常借靜電引力或配位鍵結合,因為陰離子去污劑能夠破壞這種價鍵,所以常用陰離子去污劑提取DNA.(3).苯酚抽提法:
苯酚作為蛋白變性劑,同時抑制了DNase的降解作用.用苯酚處理勻漿液時,由于蛋白與DNA 聯結鍵已斷,蛋白分子表面又含有很多極性基團與苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。離心分層后取出水層,多次重復操作,再合并含DNA 的水相,利用核酸不溶于醇的性質,用乙醇沉淀DNA。此時DNA是十分粘稠的物質,可用玻璃漫漫繞成一團,取出。此法的特點是使提取的DNA保持天然狀態.
第四篇:植物芳香油的提取教案
植物芳香油的提取
教材內容解讀
要點1 植物芳香油的來源
(1)植物芳香油的來源
天然香料的主要來源是動物和植物。動物香料主要來源于麝、靈貓、海貍和抹香鯨等。植物香料的來源更為廣泛,植物芳香油可以從大約50多個科的植物中提取。例如,玫瑰花用于提取玫瑰油,樟樹樹干用于提取樟油。
(2)植物芳香油的主要化學成分
提取出的植物芳香油的組成主要包括萜類化合物及其衍生物,具有很強的揮發性。要點2 植物芳香油的提取方法
提取植物芳香油的三種基本方法:蒸餾、壓榨和萃取。(1)蒸餾法
①水蒸氣蒸餾法的原理
利用水蒸氣將揮發性較強的植物芳香油攜帶出來,形成油水混合物,冷卻后,混合物又會重新分出油層和水層。是植物芳香提取的常用方法。
②水蒸氣蒸餾法的類型
根據蒸餾過程中原料放置的位置,可以將水蒸氣蒸餾法劃分為水中蒸餾、水上蒸餾和水氣蒸餾。
③水中蒸餾的方法對于有些原料不適用的原因 如柑橘和檸檬不適用水中蒸餾的方法,這是因為水中蒸餾會導致原料焦糊和有效成分水解等問題。因此,柑橘、檸檬芳香油的制備通常使用壓榨法。
(2)萃取法
①萃取法是將粉碎、干燥的植物原料用有機溶劑浸泡,使芳香油溶解在有機溶劑中的方法。
②原理
植物芳香油易溶于有機溶劑,如石油醚、乙醚和戊烷等。芳香油溶解于有機溶劑后,只需蒸發出有機溶劑,就可以獲得純凈的植物芳香油。
③不適于用水蒸氣蒸餾的原料,可以考慮使用萃取法。要點3 實驗設計
(1)提取玫瑰精油的實驗流程
(2)提取橘皮精油的實驗流程
石灰水浸泡→漂洗→壓榨→過濾→靜置→再次過濾→橘皮油 要點4 實驗案例
案例一 玫瑰精油的提取
5月上、中旬是玫瑰的盛開期,最好是選用當天采摘的鮮玫瑰花。將花瓣用清水沖洗,去掉上面的灰塵等雜質,瀝干水分。由于玫瑰精油化學性質穩定,從玫瑰花中提取玫瑰精油可采取水中蒸餾法。本實驗的具體操作步驟如下。1.稱取50 g玫瑰花瓣,放入500 mL的圓底燒瓶中,加入200 mL蒸餾水。按教科書圖6-2所示安裝蒸餾裝置。蒸餾裝置包括:鐵架臺兩個、酒精燈、石棉網、蒸餾瓶、橡膠塞、蒸餾頭、溫度計、直型冷凝管、接液管、錐形瓶,以及連接進水口和出水口的橡皮管。所有儀器必須事先干燥,保證無水。整套蒸餾裝置可分為左、中、右三部分,其中左邊的部分通過加熱進行蒸餾,中部將蒸餾物冷凝,右邊的部分用來接收。安裝儀器一般都按照自下而上、從左到右的順序。拆卸儀器的順序與安裝時相反。具體安裝順序和方法如下。
(1)固定熱源──酒精燈。
(2)固定蒸餾瓶,使其離熱源的距離如教科書中圖6-2所示,并且保持蒸餾瓶軸心與鐵架臺的水平面垂直。
(3)安裝蒸餾頭,使蒸餾頭的橫截面與鐵架臺平行。
(4)連接冷凝管。保證上端出水口向上,通過橡皮管與水池相連;下端進水口向下,通過橡皮管與水龍頭相連。
(5)連接接液管(或稱尾接管)。
(6)將接收瓶瓶口對準尾接管的出口。常壓蒸餾一般用錐形瓶而不用燒杯作接受器,接收瓶應在實驗前稱重,并做好記錄。
(7)將溫度計固定在蒸餾頭上,使溫度計水銀球的上限與蒸餾頭側管的下限處在同一水平線上。
2.蒸餾裝置安裝完畢后,可以在蒸餾瓶中加幾粒沸石,防止液體過度沸騰。打開水龍頭,緩緩通入冷水,然后開始加熱。加熱時可以觀察到,蒸餾瓶中的液體逐漸沸騰,蒸氣逐漸上升,溫度計讀數也略有上升。當蒸氣的頂端達到溫度計水銀球部位時,溫度計讀數急劇上升。在整個蒸餾過程中,應保證溫度計的水銀球上常有因冷凝作用而形成的液滴??刂普麴s的時間和速度,通常以每秒1~2滴為宜。蒸餾完畢,應先撤出熱源,然后停止通水,最后拆卸蒸餾裝置,拆卸的順序與安裝時相反。
3.收集錐形瓶中的乳白色的乳濁液,向錐形瓶中加入質量濃度為0.1 g/mL的氯化鈉溶液,使乳化液分層。然后將其倒入分液漏斗中,用分液漏斗將油層和水層完全分開。打開頂塞,再將活塞緩緩旋開,放出下層的玫瑰精油,用接收瓶收集。向接收瓶中加入無水硫酸鈉,吸去油層中含有的水分,放置過夜。
為了更好地將油、水兩層液體分離,操作時應注意正確使用分液漏斗。分液漏斗的使用方法如下。
(1)首先把活塞擦干,為活塞均勻涂上一層潤滑脂,注意切勿將潤滑脂涂得太厚或使潤滑脂進入活塞孔中,以免污染萃取液。
(2)塞好活塞后,把活塞旋轉幾圈,使潤滑脂分布均勻。并用水檢查分液漏斗的頂塞與活塞處是否滲漏,確認不漏水后再使用。
(3)將分液漏斗放置在大小合適的、并已固定在鐵架臺上的鐵圈中,關好活塞。將待分離的液體從上部開口處倒入漏斗中,塞緊頂塞,注意頂塞不能涂潤滑脂。
(4)取下分液漏斗,用右手手掌頂住漏斗頂塞并握住漏斗頸,左手握住漏斗活塞處,大拇指壓緊活塞,將分液漏斗略傾斜,前后振蕩(開始振蕩時要慢)。
(5)振蕩后,使漏斗口仍保持原傾斜狀態,左手仍握在漏斗活塞處,下部管口指向無人處,用拇指和食指旋開活塞,使其釋放出漏斗內的蒸氣或產生的氣體,以使內外壓力平衡,這一步操作也稱做“放氣”。
(6)重復上述操作,直至分液漏斗中只放出很少的氣體時為止。再將分液漏斗劇烈振蕩2~3 min,然后將漏斗放回鐵圈中,待液體靜置分層。
案例二 橘皮精油的提取 課前準備 在實驗前一天,教師需要準備新鮮的、沒有霉爛的橘皮,用量可根據實驗人數來決定。用清水沖洗橘皮,去掉灰塵等雜質,瀝干水分后,將橘皮攤放在干燥通風處。將晾干的橘皮浸泡在pH大于
12、質量分數為7%~8%的石灰水中,時間為16~24 h,中間翻動2~3次。浸泡好的橘皮呈黃色、無白芯、稍硬、脆而不斷、具有彈性。這樣的橘皮在壓榨時不易打滑,橘油的噴射力強;壓榨后的殘渣呈顆粒狀,殘渣中的含水量低,黏稠度不太高,過濾時比較順利,不易堵塞篩孔。
提取橘皮精油的具體步驟如下。
1.將浸泡后的橘皮,用流動的水漂洗,洗凈后撈起、瀝干。切記一定要將橘皮徹底沖洗干凈。然后將橘皮粉碎至3 mm大小,放入家用榨汁機或手動壓榨機中粉碎。粉碎時加入與橘皮同質量的質量分數為0.25%的小蘇打和質量分數為5%的硫酸鈉溶液,并調節pH為7~8。
2.在榨出的油水混合液中加入明礬,使之沉淀并變澄清,然后用布袋過濾,除去糊狀殘渣。再將得到的混合物,用6 000 r/min~8 000 r/min的轉速進行高速離心。在正常情況下,離心后獲得的香精油將是澄清透明的。
3.分離出的香精油往往帶有少量水分和蠟質等雜質,為了進一步除去雜質,可以將分離的產品放在5 ℃~10 ℃的冰箱中,靜置5~7 d,讓雜質與水下沉。然后用吸管吸出上層澄清的油層,再通過墊有濾紙或石棉紙的漏斗進行減壓抽濾,得到黃色油狀的橘皮精油。
第五篇:優質課教案---植物芳香油的提取教案
2010年河南省高中生物優質課
植物芳香油的提取
姓 名: 李 宴 會 單 位: 上 蔡 一 高 日 期: 2010 年 8月
專題6 植物有效成分的提取 課題1 植物芳香油的提取
一、課題目標
本課題通過設計簡易的實驗裝置來提取植物芳香油,使學生了解提取植物芳香油的基本原理,研究從生物材料中提取特定成分的方法,初步學會某些植物芳香油的提取技術。
二、課題重點與難點
課題重點:植物芳香油的提取技術;針對原料的不同特點,采用適宜的提取方法。課題難點:植物芳香油的提取技術;針對原料的不同特點,采用適宜的提取方法。
三、課題背景分析
課題背景從古代人類將芳香植物或花卉制成干品,當作藥物和香料使用談起,引入到歐洲中世紀香料貿易的發展,促成了植物芳香油提取技術的誕生,反映了社會生活的需要對科學技術的推動。隨著有機化學的發展,人造香料日益普及,但人們對天然植物芳香油仍情有獨鐘,它一方面說明了科學技術的發展賦予了人類更多的自由,同時也反映了人造物依舊很難取代自然產物的事實。在充分體現了植物芳香油與人類社會生產生活的緊密聯系后,教材說明了本課題的目標:了解提取植物芳香油的原理,設計簡單的實驗裝置,從橘皮或玫瑰花中提取芳香油。在教學中可充分利用上述素材,對學生進行生動的科學、技術、社會的教育,并激發學生動手實踐的興趣。
四、基礎知識分析與教學
(一)植物芳香油的來源
知識要點:1.植物芳香油的來源和發展歷史;2.植物芳香油的主要化學成分。教學:在介紹植物芳香油的來源時,宜結合教材提供的旁欄資料進行講解,讓學生對植物芳香油的廣泛來源有一個初步的了解。還可以采取學生查閱資料和介紹相關的小故事等方式,使學生大致了解植物芳香油的發展歷史。
(二)植物芳香油的提取方法
知識要點:提取植物芳香油的三種基本方法:蒸餾、壓榨和萃取。
教學:可以通過列舉日常生活中的一些具體事例,幫助學生熟悉提取植物芳香油的三種基本方法,并理解其原理。例如,實驗室制備蒸餾水就用到了蒸餾的方法;超市出售的手動榨汁器,其原理與教材介紹的壓榨法是類似的;等等。此外,還應引導學生分析這三種方法 的優點與不足,讓學生嘗試根據不同的原料,選用適宜的提取方法。
五、實驗案例 玫瑰精油的提取
5月上、中旬是玫瑰的盛開期,最好是選用當天采摘的鮮玫瑰花。將花瓣用清水沖洗,去掉上面的灰塵等雜質,瀝干水分。由于玫瑰精油化學性質穩定,從玫瑰花中提取玫瑰精油可采取水中蒸餾法。本實驗的具體操作步驟如下。
1.稱取50 g玫瑰花瓣,放入500 mL的圓底燒瓶中,加入200 mL蒸餾水。按教科書圖6-2所示安裝蒸餾裝置。蒸餾裝置包括:鐵架臺兩個、酒精燈、石棉網、蒸餾瓶、橡膠塞、蒸餾頭、溫度計、直型冷凝管、接液管、錐形瓶,以及連接進水口和出水口的橡皮管。所有儀器必須事先干燥,保證無水。整套蒸餾裝置可分為左、中、右三部分,其中左邊的部分通過加熱進行蒸餾,中部將蒸餾物冷凝,右邊的部分用來接收。安裝儀器一般都按照自下而上、從左到右的順序。拆卸儀器的順序與安裝時相反。具體安裝順序和方法如下。
(1)固定熱源──酒精燈。
(2)固定蒸餾瓶,使其離熱源的距離如教科書中圖6-2所示,并且保持蒸餾瓶軸心與鐵架臺的水平面垂直。
(3)安裝蒸餾頭,使蒸餾頭的橫截面與鐵架臺平行。
(4)連接冷凝管。保證上端出水口向上,通過橡皮管與水池相連;下端進水口向下,通過橡皮管與水龍頭相連。
(5)連接接液管(或稱尾接管)。
(6)將接收瓶瓶口對準尾接管的出口。常壓蒸餾一般用錐形瓶而不用燒杯作接受器,接收瓶應在實驗前稱重,并做好記錄。
(7)將溫度計固定在蒸餾頭上,使溫度計水銀球的上限與蒸餾頭側管的下限處在同一水平線上。
2.蒸餾裝置安裝完畢后,可以在蒸餾瓶中加幾粒沸石,防止液體過度沸騰。打開水龍頭,緩緩通入冷水,然后開始加熱。加熱時可以觀察到,蒸餾瓶中的液體逐漸沸騰,蒸氣逐漸上升,溫度計讀數也略有上升。當蒸氣的頂端達到溫度計水銀球部位時,溫度計讀數急劇上升。在整個蒸餾過程中,應保證溫度計的水銀球上常有因冷凝作用而形成的液滴??刂普麴s的時間和速度,通常以每秒1~2滴為宜。蒸餾完畢,應先撤出熱源,然后停止通水,最后拆卸蒸餾裝置,拆卸的順序與安裝時相反。
3.收集錐形瓶中的乳白色的乳濁液,向錐形瓶中加入質量濃度為0.1 g/mL的氯化鈉溶
液,使乳化液分層。然后將其倒入分液漏斗中,用分液漏斗將油層和水層完全分開。打開頂塞,再將活塞緩緩旋開,放出下層的玫瑰精油,用接收瓶收集。向接收瓶中加入無水硫酸鈉,吸去油層中含有的水分,放置過夜。
為了更好地將油、水兩層液體分離,操作時應注意正確使用分液漏斗。分液漏斗的使用方法如下。
(1)首先把活塞擦干,為活塞均勻涂上一層潤滑脂,注意切勿將潤滑脂涂得太厚或使潤滑脂進入活塞孔中,以免污染萃取液。
(2)塞好活塞后,把活塞旋轉幾圈,使潤滑脂分布均勻。并用水檢查分液漏斗的頂塞與活塞處是否滲漏,確認不漏水后再使用。
(3)將分液漏斗放置在大小合適的、并已固定在鐵架臺上的鐵圈中,關好活塞。將待分離的液體從上部開口處倒入漏斗中,塞緊頂塞,注意頂塞不能涂潤滑脂。
(4)取下分液漏斗,用右手手掌頂住漏斗頂塞并握住漏斗頸,左手握住漏斗活塞處,大拇指壓緊活塞,將分液漏斗略傾斜,前后振蕩(開始振蕩時要慢)。
(5)振蕩后,使漏斗口仍保持原傾斜狀態,左手仍握在漏斗活塞處,下部管口指向無人處,用拇指和食指旋開活塞,使其釋放出漏斗內的蒸氣或產生的氣體,以使內外壓力平衡,這一步操作也稱做“放氣”。
(6)重復上述操作,直至分液漏斗中只放出很少的氣體時為止。再將分液漏斗劇烈振蕩2~3 min,然后將漏斗放回鐵圈中,待液體靜置分層。橘皮精油的提取
課前準備
在實驗前一天,需要準備新鮮的、沒有霉爛的橘皮,用量可根據實驗人數來決定。用清水沖洗橘皮,去掉灰塵等雜質,瀝干水分后,將橘皮攤放在干燥通風處。將晾干的橘皮浸泡在pH大于
12、質量分數為7%~8%的石灰水中,時間為16~24 h,中間翻動2~3次。浸泡好的橘皮呈黃色、無白芯、稍硬、脆而不斷、具有彈性。這樣的橘皮在壓榨時不易打滑,橘油的噴射力強;壓榨后的殘渣呈顆粒狀,殘渣中的含水量低,黏稠度不太高,過濾時比較順利,不易堵塞篩孔。
提取橘皮精油的具體步驟如下。
1.將浸泡后的橘皮,用流動的水漂洗,洗凈后撈起、瀝干。一定要將橘皮徹底沖洗干凈。然后將橘皮粉碎至3 mm大小,放入家用榨汁機或手動壓榨機中粉碎。粉碎時加入與橘皮同質量的質量分數為0.25%的小蘇打和質量分數為5%的硫酸鈉溶液,并調節pH為7~8。
2.在榨出的油水混合液中加入明礬,使之沉淀并變澄清,然后用布袋過濾,除去糊狀殘渣。再將得到的混合物,用6 000 r/min~8 000 r/min的轉速進行高速離心。在正常情況下,離心后獲得的香精油將是澄清透明的。
3.分離出的香精油往往帶有少量水分和蠟質等雜質,為了進一步除去雜質,可以將分離的產品放在5 ℃~10 ℃的冰箱中,靜置5~7 d,讓雜質與水下沉。然后用吸管吸出上層澄清的油層,再通過墊有濾紙或石棉紙的漏斗進行減壓抽濾,得到黃色油狀的橘皮精油。
六、課題成果評價
(一)是否提取出了植物精油
觀察學生提取出的玫瑰精油或橘皮精油,從顏色、氣味等方面來評價所提取的精油的純度和質量。從玫瑰花提取的芳香油是淺黃色至黃色的液體,并帶有甜韻的玫瑰香;從橘皮提取的橘皮精油無色透明,具有誘人的橘香味。本課題只是對兩種精油進行了初步的提取,其中仍然含有大量的雜質。
(二)出油率的計算
根據教科書提供的公式計算出油率。如果出油率高,說明實驗方案設計合理;如果出油率低,可以幫助學生從實驗方法的選擇、實驗過程的操作等各方面分析原因,改進后再作嘗試。