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“實用生物信息技術”課程總結

時間:2019-05-12 22:06:29下載本文作者:會員上傳
簡介:寫寫幫文庫小編為你整理了多篇相關的《“實用生物信息技術”課程總結》,但愿對你工作學習有幫助,當然你在寫寫幫文庫還可以找到更多《“實用生物信息技術”課程總結》。

第一篇:“實用生物信息技術”課程總結

“實用生物信息技術”課程總結

1.收獲

1)學會了資源搜索。研究生的一個必備工作是讀閱讀文獻,分析文獻,但我在文獻搜集方面知識比較欠缺,本科的時候使用比較多的是學校圖書館數據庫,萬方數據庫,中國知網等,而對于專業外文文獻的搜集并不會。我覺得上實用信息技術課最大的收獲是如何搜索自己需要的文獻。文獻搜索的講解主要放在第一次課和第二次課。當時就覺得沒有白選這門課,這門課的確很實用,作為一個輔助工具輔助我的學習。主要搜索基本可以通過abc主頁進入,包括PDB, NBCI, Uniprot等。

2)加深了課題認識。除了本科期間做的實驗,畢業后我沒有參與研究所實驗室的實驗,這使我對本研究所本團隊的研究領域并不清楚,盡管也咨詢了師兄師姐但認識仍然比較淺。但在羅老師的嚴格要求下,通過不斷與導師聯系,我對本實驗室的認識也加深了,對自己將來可能研究的課題有了更進一步的了解,這對于我今后進實驗室進行研究有了積極的作用。3)了解了分析工具。

在整個課程中,老師講解了各種蛋白質集基因序列的分析工具,使我倍感受益,以前在課堂上看到的蛋白質結構圖,在論文上看到的序列比對分析圖,自己也能做出來的時候真的很有成就感,原來未知的知識有這么多。今后我也會繼續練習,爭取熟練運用老師上課講的各種工具。這些工具主要有:Weblab分析平臺(Emma多序列比對,coderet獲取全長基因組的對應序列),Blast數據庫相似性搜索,Mega軟件的使用,Swiss-PDB viewer蛋白結構比較軟件。

2.感悟

用在學習上再多的時間也不過分。Half a day on abc saves a month in the lab。這句話對我啟發很大,有的知識你感覺很難,但是只要肯下功夫,一切難題都會迎刃而解,更何況現在所碰到的根本不是大的難題,而僅僅是因為自己對專業課題的認識不深或者基本知識沒有掌握而遇到的問題,這些問題基本上通過查閱文獻和閱讀使用說明就能夠解決的。

3.遺憾

最遺憾的是自己對自己的課題沒有非常深入的了解,僅閱讀了幾篇文獻,因此在課程操作當中,并沒有盡善盡美的對自己的課題完成一個深入的報告。

4.計劃 接下來,我會將進一步深入探究自己的課題,利用上課所學知識完成對自身課題的初步研究,以北大同學做的報告為鑒,對自己的課題做一個完美的報告。

最后一堂課來的很匆忙,沒想到這次竟然是我們實用生物信息技術的最后一堂課,真的舍不得。感覺要學的東西真的剛剛開始,我們這幾天的學習在abc無限的資源里面真的是九牛一毛,那么多的Tools,Literature,database我們都還沒怎么接觸。老師說有些人可能一輩子都用不完。這么多寶貴的資源在這兒,我們怎能浪費。如果不能好好利用這些前人總結下來,創造下來的資源,那真的是太可惜。

我覺得能夠碰到這樣一位教學嚴謹的老師,是我們莫大的福分。雖然基本操作都會了,但仍然需要認真練習,利用例題同時也利用自己課題的研究對象尋求更好的方法去得到自己想要的結構。當然里面還有很多需要我們繼續探討的操作,這些都需要我們自己在課后補充了。把基礎打好了,我相信后面的能夠通過努力練習都能熟能生巧。另外,老師在課堂上還講了很多活生生的例子,以期來警示我們不要為了讓結構漂亮而忘記實驗的初衷,結構上,最主要的還是要知道它的功能,不能做出來一張漂亮的圖片,卻不知道每個原子,基團代表什么,不能從圖片上讀到有用信息就是失敗的圖片。老師展示了一個同學的關于pymol viewer的PPT,我最喜歡上面的自己做的動畫,相信自己也能摸索著做出來用于自己的課題,當然我會在理解其結構基礎上再做這些工作。對于老師推薦的一些有用的網站,數據庫和工具。比如phyre,protscale,dotlet,AAAAA抗體相關網站等等。每種工具都含蘊著很多有用的知識,作為科研人員,我們很多人以后都要走在行業的前列,我們有必要將自己武裝到最好,不負所期。課程永遠不會結束。我知道,接下來的學習中,我們會更加深刻理解自己的課題,這樣會更好的利用課上所學知識應用到自己的課題上,不懂的地方,老師永遠愿意幫助你。感謝羅老師。我會好好利用課上所學知識,服務于自己課題,做到真正掌握。

第二篇:實用生物信息技術課程期末總結

實用生物信息技術課程期末總結

北京大學生命科學學院 2012年8月1日

姓名_________學號____________電話____________ 座位號_____郵箱___________________ 得分______

(按學號為文件名保存為WORD 2003文檔,如1001210241.DOC,8月20日前發送至pku12s@yahoo.cn)

簡述你正在進行或準備開始的研究課題的研究背景和科學意義。通過文獻閱讀、數據庫檢索,利用序列分析、數據庫搜索、結構分析和模擬等各種生物信息學工具,分析你研究課題涉及的蛋白質及其編碼基因的序列特征,說明其可能的代謝通路和調控網絡,分析或推測其可能的生物學功能;對不同物種中的直系同源基因和同一物種中的旁系同源基因進行系統發育分析,推斷該基因家族的起源和演化。

? 以上總結過程中可通過計算機網絡進行交流,在交流基礎上獨立完成上述練習題,嚴禁互相抄襲。? 引用文獻資料,必須注明出處,嚴禁照抄網上現有資料。

第三篇:信息技術與生物課程的整合(定稿)

淺論信息技術與生物課程的整合

摘 要:隨著新課改的的不斷深入,信息技術與學科課程的整合是當前基礎教育改革的一個新視點。在生物學科的教學中,新教材教學難度增加了,對教師的要求也更高了。生物教學課本中涉及的圖、文、形、像很多,這要求學生在學習過程中發揮主觀能動性,去看,去聽,去想。信息技術可以化靜為動,化抽象為直觀,吸引學生注意,降低理解難度。信息技術與生物教學整合,可以創新教學模式,增大課堂容量,突出重點,解決難點,可以增強學生學習興趣,提高教學效果,優化教學過程,培養學生能力。本文就信息技術與生物課程整合的本質、基本原則和途徑、方法等做了一定的闡述。

關鍵詞: 生物課程 信息技術 整合

一、信息技術與生物課程的整合的本質

信息技術與生物課程整合是信息時代課程教學改革的需要,是信息時代人才培養的需要,是提高生物學科教學效率的根本途徑。以計算機為核心的信息技術作為新型教學媒體,當它們與生物課程加以整合,即與生物學科的教學進程密切結合時,它們可以體現出許多對于教育、教學過程來說極為寶貴的特性,從而為新型教學結構的創建提供最理想的教學環境。所以研究信息技術與生物課程整合的教學策略,具有重要實踐指導意義。

所謂整合就是根據學科教學需要,充分發揮計算機的工具性功能,使計算機溶入學科教學中,從而提高教學質量,促進教學改革,培養具

有創造能力和創新精神的中學生。整合并非是將計算機與生物學科的簡單結合,也并不能夠解決生物教學中的所有問題,而是從實際出發,尋找最佳結合點,突出教學重點,解決難點,探索規律,啟發思維,從而提高生物學科的教育教學質量。

二、信息技術與生物課程整合的基本原則

建構主義認為,知識不是通過教師傳授得到,而是學習者在一定情境即社會文化背景下,借助他人(包括教師和學習伙伴)的幫助,利用必要的學習資料,通過意義建構的方式而獲得。學習要以學生為中心,不僅要求學生由外部刺激的被動接受者和知識的灌輸對象轉變為信息加工的主體、知識意義的主動建構者,而且要求教師要由知識的傳授者、灌輸者變為學生主動建構意義的幫助者、促進者。

轉化被動學習為主動學習,強調學生對知識的主動探索、主動發現和對所學知識意義的主動建構,而不是像傳統教學那樣,只是把知識從教師頭腦中傳送到學生的筆記本上,它強調的是“學”。在整個教學過程中,教師應利用情境、協作、會話等學習環境要素充分發揮學生的主動性、積極性和首創精神,最終使學生有效地實現對當前所學知識的意義建構。

教師要運用信息技術的多媒體技術等,為學生提供豐富的圖、文、聲等資料,創設一個生動的教學情境和一個自主的學習情境,激發學生學習生物知識的求知欲和好奇心。在教師精心設計的學習環境下,學生主動去收集并分析有關生物知識的信息和資料,對所學習的生物學問題

提出各種假設并努力加以驗證,把當前學習內容盡量與自己已有的生物知識經驗聯系起來,最終達到當前所學的生物知識的意義建構的目的。由于建構主義所要求的學習環境得到了當代最新信息技術成果的強有力支持,所以成為信息技術與生物課程整合的理論基礎。

三、信息技術與生物課程整合的途徑、方法

如何將信息技術與生物學科進行有機的整合是關鍵問題。我日常教學設計的原則是:突出學生的主體地位,強調自主協作學習;分層次教學,面向全體學生,體現個性化學習,激勵學生創新,培養鍛煉學生的學習能力、利用信息技術的能力和科學創新精神。

在生物教學過程中,不但強調學生的認知主體作用,還要特別強調的是教師的引導和指導作用,強調師生互動。教師是學生意義建構的幫助者、促進者,教師應在可能的條件下,提出適當的問題以引起學生的思考和討論,組織協作學習(開展討論與交流),在討論中設法把問題一步步引向深入,加深學生對所學知識內容的理解,并對協作學習過程進行引導,使之朝有利于學生意義建構的方向發展。

1、常用軟件做為思維支持工具

思維支持工具不等于就是簡單的課件制作工具。常規的計算機輔助教學往往要為一節課制作一個課件,課件使用的靈活性不大,而且在實施教學前要作大量的準備工作。其實計算機本身就具有強大的教學功能,如利用計算機中的圖表工具進行數據統計,只要輸入相應的數據,計算機在幾秒鐘之內便自動產生統計圖,而且可以根據需要產生不同形式的統計圖表。這樣可以將更多的時間放在對數據變化趨勢的分析推斷上,培養學生的分析應用能力。實踐表明,學生通過整合教學,既達到

了學會看統計圖,能根據數據的變化做出適當的分析與推測;又達到了學會用圖表工具制作統計圖的信息技術教學目標;還激發了使用計算機的興趣,大大提高了教學效率。

2、充分發揮計算機信息加工能力

強大的信息加工能力是計算機的一個重要特點。讓學生對信息進行重整、加工和再應用,在大量信息中快速提取有用的信息,從而培養信息加工能力和流暢的表達能力,達到對大量知識的內化。學生在虛擬的網絡中收集相關材料,包括文字、圖片、動畫等,然后根據學習目標進行信息篩選,并對選取的信息進行分析加工,再進行組合和再創造,最終得到學習成果,有的學生還把學習成果制作成網頁的形式。在這里,計算機一方面在學生學習過程中扮演“信息工具”的角色,促使他們的信息素養得到提高,另一方面以“出版工具”的角色出現,幫助他們整理知識,綜合應用所學的語文寫作、美術繪畫和欣賞等多項知識完成研究報告,使知識內化并激活。

3、創設模擬實驗的整合教學

當今時代,是信息技術的高速發展的時代。新技術在教學中的應用更為學生的探索和學習提供了強有力的支持。許多在現實中很難做到的試驗,可以通過計算機來模擬,從而給學生以真切感,促進學生掌握知識、發展能力。例如《減數分裂》一課,本節課所涉及到的知識較為抽象,雖然可以在顯微鏡下觀察細胞分裂的裝片,但在顯微鏡下看到的只是細胞分裂過程中的某一個時期的圖形,而減數分裂本身是一個連續的動態的過程。為了讓學生能更好地理解這一知識,并真正提高應用能力,在教學中可以利用計算機來進行模擬試驗,設計制作減數分裂中“精子的形成”過程的多媒體課件,整個過程可控性強,讓學生自己操作,體驗“細胞連續分裂兩次”的含義,幫助做出正確的理解。更為重要的是,通過整合,學生真切地認識到信息技術應用的重要性和學習方式革命的緊迫性。

4、使用網站開展研究性學習

在指教師在指導下,讓學生開展研究性學習。從自身生活和社會生活中選擇和確定研究專題,以類似科學研究的方式主動地獲取知識、應用知識、解決問題。研究性學習的過程正是一個人際溝通與合作的過程。其目的是為了更好地培養學生信息收集和處理能力,發展創新精神,獲得親自參與研究探索的積極體驗和提高溝通與合作能力。計算機網絡技術為更好地開展研究性學習和實現協作式學習提供了良好的技術基礎和支持環境。如:提供豐富的研究資源、創設生動的研究情境、大大地擴充協作范圍,提高協作的效率、改革學習的方式。

遂然我在信息技術與學科教學整合的實驗研究中進行了一些初步的嘗試和探索,但是,信息技術與課程整合是一個漫長的、歷盡艱辛的過程,只有通過我們教育工作者的全體參與和不懈努力,才能使我國的基礎教育改革躍上一個新臺階。

參考文獻:

[1]教育部.《中信息技術課程指導綱要(試行)》教育部文件,教基[2000]35號 [2]陸建身.生物教育展望[M].上海:華東師范大學出版社,2001年11月

[3] 章劍衛.《信息技術與課程整合的研究與實踐》,載《浙江教學研究》,2000年 [4]楊改學.現代教育技術教程[M].甘肅:甘肅省教育出版社,2001年3月 [5]龐國斌,王冬凌.合作學習的理論與實踐[M].北京:開明出版社, 2001年5月 [6]何克抗.建構主義—革新傳統教學的理論基礎.北京:北京師范大學出版社,1998年

第四篇:生物校本課程總結

生物校本課程總結

蘇鵬

本學期生物校本課程是《科學營養與健康》,采用學生自由選課的方式授課,選課學生為32人,固定教室是化學實驗室,采用課件、講授、視頻圖像的方式對學生進行指導。開設本課程的主要目的是讓學生了解與生物學有關的課外知識,豐富學生的課余生活,提高學生學習生物的興趣。授課方式相對比較輕松,為學生營造了相對寬松的學習環境,普遍受到學生的歡迎。涌現出了個別對生物非常感興趣的學生,為以后進行常規生物學習奠定了基礎。對涌現出來的個別對感興趣的學生以后可以發展生物競賽。

生物校本課程的主要內容:一是中學生的飲食營養,講解學生普遍比較關注的問題。提倡健康的生活方式,現在中學生身體健康狀況不是很好,與飲食和缺乏鍛煉有很大關系。本課主要通過飲食方面的講述,讓學生養成良好的生活習慣。二是講解流行病的預防及治療,重在預防。這兩部分內容學生比較感興趣,開課情況較好,教師在講授過程中,注意與學生的互動,打破教師的一言堂,參與學生的討論。教師在開課過程中,多列舉與現實生活密切聯系的生活實例,提高學生學習興趣。

授課方式的多樣化,課件、講授、視頻、圖像等形式,學生容易接受,相比較普通的授課方式,更加直觀,內容多樣化,教學手段也富有變化。開課地點主要在化學實驗室,時間為每周三下午第三節。通過一節課的形式,讓學生對本節的學習情況了解和掌握。時間雖然不是很長,但教師在課上主要是起引導作用,勾起學生學習興趣,大部分時間仍然是在課后,學生的主動學習。

授課過程中存在的問題,部分學生在思想上仍然沒有引起足夠的重視,認為上校本課程就是放松,甚至極個別學生存在缺課情況,針對此種情況,我制定了上課點名的制度,即抽點。在一定程度上避免了部分學生上課產生的倦怠情況,通過學生上課的表現來給學生打分,促進了學生積極性的提高。

通過開設校本課程,讓學生發現了學習生物學的另一面,不是枯燥的文字,難以理解的公式,原理。而是與生活密切相關的簡單原理應用。開闊了學生的思維。

第五篇:生物實驗課程總結

生物實驗課程總結

謝天佑物理42 2014012228 這學期我總共完成了四個實驗:啤酒與酸奶制作和微生物觀察,ELISA實驗,顯微鏡的使用與小白鼠腹腔血細胞的觀察和蟾蜍解刨實驗。

啤酒與酸奶制作和微生物觀察:

這個實驗讓我學會了制作酸奶的具體流程,還有制作啤酒的流程。并且讓我了解到我們周邊的微生物竟然是如此之多。

ELISA實驗:

本實驗讓我們學習了酶相互反應失活的現象,然后用硫酸和顯色溶劑讓我們觀察到反應液濃度引起的顯色梯度。收獲是讓我們感受到酶的劑量可以如此小,而作用是如此之明顯。

顯微鏡的使用與小白鼠腹腔血細胞的觀察:

這個實驗使用的是雙目顯微鏡,十分新鮮。我以前從來沒有接觸過如此強大的顯微鏡。并且我還把所有的切片標本進行了一遍觀察。發現了我們周邊世界竟然有如此多的微觀結構,可是我們的肉眼竟然看不見!我們看見的確是我們視覺的分辨率所致的平均效果。并且我觀察了肌肉細胞,神經細胞,魚鱗細胞等等。而他們的結構更是神奇。后面還觀察了小鼠腹腔的腹腔血細胞。不過解刨小鼠的過程還是會很有心里負擔的,不過后來在解刨蟾蜍實驗聽了生物倫理后心里感覺好多了。

蟾蜍解刨實驗:

該實驗就讓我對解刨生物不再產生自卑感。并且了解并學會識別了生物的內臟等器官。其中包括心臟,肺腔,胃,卵巢,大腸,小腸,淋巴結等內臟結構。

總結:

整個生物實驗的學習給了我很多的體驗。讓我了解了微觀的生物們的活潑運動。了解生物身體里面的復雜結構,這一次是真正的看見,以前的聽聞只能說是唯象的理論。學習使用顯微鏡,學習使用很多的不曾接觸的儀器。并且讓我明白了生物倫理是多么的重要,我不能做出違背自己良心底線的東西。殺害小動物后也要給她們建立一個墓碑。這樣以緬懷她們對科學的獻身。敬!

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