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PCR實驗室要求和基本設備

時間:2019-05-15 01:40:10下載本文作者:會員上傳
簡介:寫寫幫文庫小編為你整理了多篇相關的《PCR實驗室要求和基本設備》,但愿對你工作學習有幫助,當然你在寫寫幫文庫還可以找到更多《PCR實驗室要求和基本設備》。

第一篇:PCR實驗室要求和基本設備

PCR實驗室的基本設備與要求

一、臨床基因擴增檢驗實驗室區域設置原則

(一)臨床基因擴增檢驗實驗室區域設置原則

1、試劑儲存和準備區

2、標本制備區

3、擴增反應混合物配制和擴增區

4、擴增產物分析區 如使用全自動分析儀,區域可適當合并。

(二)各工作區域必須有明確的標記,避免不同工作區域內的設備、物品混用。

(三)進入各工作區域必須嚴格按照單一方向進行

即試劑儲存和準備區 —>標本制備區—>擴增反應混合物配制和擴增區—>擴增產物分析區。

(四)不同的工作區域使用不同的工作服(例如不同的顏色)。工作人員離開各工作區域時,不得將工作服帶出。

二、工作區域儀器設備配置標準

(一)試劑儲存和準備區 1、2-8C和-15C冰箱

2、混勻器

3、微量加樣器(覆蓋1-1000ul)

4、移動紫外燈(近工作臺面)

5、消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、耐高壓處理的離心管和加樣器吸頭(帶濾心)

6、專用工作服和工作鞋

7、專用辦公用品

(二)標本制備區 1、2-8C冰箱、-20C或-80C冰箱

2、高速臺式冷凍離心機

3、混允器

4、水浴箱或加熱模塊

5、微量加樣器(覆蓋1-1000ul)

6、可移動紫外燈(近工作臺面)

7、超凈工作臺

8、消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、耐高壓處理的離心管和加樣器吸頭(帶濾心)

9、專用工作服和工作鞋

10、專用辦公用品,如需處理大分子DNA,應具有超聲波水浴儀。

(三)擴增反應混合物配制和擴增區

1、核酸擴增儀

2、微量加樣器(覆蓋1-1000ul)

3、可移動紫外燈(近工作臺面)

4、消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、耐高壓處理的離心管和加樣器吸頭(帶濾心)

5、專用工作服和工作鞋

6、專用辦公用品(四)擴增產物分析區

視檢驗方法不同而定,基本儀器設備如下:

1、微量加樣器(覆蓋1-1000ul)

2、可移動紫外燈(近工作臺面)

3、消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、加樣器吸頭(帶濾心)

4、專用工作服和工作鞋

5、專用辦公用品

臨床基因擴增檢驗實驗室的規范化設置及其管理

(一)試劑貯存和準備區

下述操作在該區進行:貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應混合液的制備。貯存試劑和用于標本制備的材料應直接運送至試劑貯存和準備區,不能經過產物分析區。在打開含有反應混合液的離心管或試管前,應將其快速離心數秒。試劑原材料必須貯存在本區內,并在本區內制備成所需的貯存試劑。當貯存試劑溶液經檢查可用后,應將其分裝貯存備用,避免由于經常打開反應管吸液而造成污染。

含反應混合液的離心管或試管在冰凍前都應快速離心數秒。大多數用于擴增的試劑都應冰凍貯存。為避免因單次反應取液而頻繁的凍融主貯存試劑,應分裝冰凍貯存試劑溶液。貯存試劑的分裝體積根據通常在實驗室內一次測定所需的擴增反應數來決定。

主反應混合液的組成成份尤其是聚合酶的適用性和穩定性通過預試驗來檢查,評價結果必須有書面報告。對于“熱啟動”技術(在第一個高溫變性步驟后加入酶),聚合酶也可不包含在主反應混合液中。

在整個本區的實驗操作過程中,操作者必須戴手套,并經常更換。此外,操作中使用一次性帽子也是一個有效地防止污染的措施。

嚴禁用嘴吸取液體,加樣器和吸頭等必須經高壓處理。工作結束后必須立即對工作區進行清潔。本工作區的實驗臺表面應可耐受諸如次氯酸鈉的化學物質的消毒清潔作用。實驗臺表面的紫外照射應方便有效。由于紫外照射的距離和能量對去污染的效果非常關鍵,因此可使用可移動紫外燈(254nm波長),在工作完成后調至實驗臺上60~90cm內照射。由于擴增產物僅幾百bp,對紫外線損傷不敏感,因此紫外照射擴增片段必須延長照射時間,最好是照射過夜。實驗室及其設備的使用必須有日常記錄。(二)標本制備區

下述操作在該區進行:臨床標本的保存,核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴增反應管和測定RNA時cDNA的合成。要正確使用加樣器。由于在加樣操作中可能會發生氣溶膠所致的污染,所以應避免在本區內不必要的走動??赏ㄟ^在本區內設立正壓條件避免從鄰近區進入本區的氣溶膠污染。為避免樣本間的交叉污染,加入待測核酸后,必須蓋好含反應混合液的反應管。對具有潛在傳染危險性的材料,必須有明確的樣本處理和滅活程序。

用過的加樣器吸頭必須放入專門的消毒(例如含次氯酸鈉溶液)容器內。實驗室桌椅表面每次工作后都要清潔,實驗材料(原始血標本、血清標本、提取中的標本與試劑的混合液等)如出現外濺,則必須分別處理并作出記錄。

對實驗臺適當的紫外照射(254nm波長,與工作臺面近距離)適合于滅活去污染。可移動紫外線管燈可用來確保工作后對實驗臺面的充分照射。樣本處理對核酸擴增有很大影響,必須使用有效的核酸提取方法,可在開展臨床標本檢測前對提取方法進行評價。

用于RNA擴增檢測的樣本制備好以后,應立即進行cDNA合成,因為cDNA鏈較RNA穩定,保存相對容易。為保證逆轉錄反應的需要,應在標本制備區設置一個以上的溫育裝置。

cDNA合成的理想溫度依所使用的酶而定,傾向于使用一步法:即使用在擴增反應緩沖液條件下具有逆轉錄活性的熱穩定的DNA聚合酶進行逆轉錄,其較cDNA合成后再開蓋以調節緩沖液或加入聚合酶進行擴增發生污染的可能性降低。

待測RNA的cDNA拷貝須保存在標本制備區,不得在本區對樣本進行PCR擴增。(三)擴增區

下述工作在本區內進行:DNA或cDNA擴增。此外,已制備的DNA模板和合成的cDNA(來自樣本制備區)的加入和主反應混合液(來自試劑貯存和制備區)制備成反應混合液等也可在本區內進行。在巢式PCR測定中,通常在第一輪擴增后必須打開反應管,因此巢式擴增有較高的污染危險性,第二次加樣必須在本區內進行。不能從本區再進入任何“上游”區域,可降低本區的氣壓以避免氣溶膠從本區漏出。為避免氣溶膠所致的污染,應盡量減少在本區內的走動。如有加樣則應在超凈臺內進行。打開預處理過的反應混合液時必須防止液體濺出,尤其是在巢式擴增步驟之間。一個簡單的方法是在打開反應管前快速離心數秒??墒褂皿w積較小的離心機,因其所占實驗臺面小,易于用一只手操作,適合于大多數超凈臺。防潮屏障如石蠟油或輕礦物油也具有防污染作用,但必須注意的是,礦物油本身也可能成為一種持續性的污染源。用過的加樣器必須注意清潔消毒。

完成操作及每天工作后都必須對實驗室臺面進行清潔和消毒,紫外照射方法與前面區域相同。如有溶液濺出,必須處理并作出記錄。(四)擴增產物分析區

下述操作在本區內進行:擴增片段的測定。

核酸擴增后產物的分析方法多種多樣,如膜上或微孔板上探針雜交方法(同位素標記或非同位素標記)、瓊脂糖凝膠電泳、聚丙烯酰胺凝膠電泳、Southern轉移、核酸測序方法等。目前國內的商品試劑盒絕大部分均采用非同位素標記的微孔板上探針雜交方法,即PCR-ELISA方法,也有膜上探針雜交方法。本區是最主要的擴增產物污染來源,因此必須注意避免通過本區的物品及工作服將擴增產物帶出。在使用PCR-ELISA方法檢測擴增產物時,必須使用洗板機洗板,廢液必須收集至1mol/L HC1中,并且不能在實驗室內傾倒,而應至遠離PCR實驗室的地方棄掉。用過的吸頭也必須放至1mol/L HCl中浸泡后再放到垃圾袋中按程序處理,如焚燒。由于本區有可能會用到某些可致基因突變和有毒物質如溴化乙錠、丙烯酰胺、甲醛或同位素等,故應注意實驗人員的安全防護。

本區的清潔消毒和紫外照射方法同前面區域。本區如采用負壓條件或減壓情況下(如安裝排風扇)可減少擴增產物從本區擴散至前面區域的可能性。

第二篇:PCR實驗室

高端PCR實驗室控制設計說明

PCR實驗室即分子生物學實驗室,在醫療、科研、生物技術方面得到廣泛的應用。因其在不同行業的應用各有區別,在具體設計時也有不同之處,就醫療機構的應用而言,主要使用三區或四區設計,即試劑準備區、樣品提取區、擴增分析區;此類三區設計時候應用于類似熒光定量型或同類PCR分析設備,及擴增與分析過程在設備內一次完成。而四區設計在三區的基礎上講擴增分析區拆分為擴增區與分析區適用于其他類型的pcr設備及手工處理。

在PCR實驗的設計上,經過多年的經驗累積,已經在一些關鍵技術上達成了共識。因為PCR實驗中所產生的DNA與RNA片段過于微小,以至于可以穿透高效過濾器,所以在實驗室設計上已經不在強制要求設計高效凈化系統,但是為了提高實驗環境水平及保護實驗室內的敖貴設備方面,如果在具備條件的情況下可考慮追加高效空氣凈化系統;建議凈化級別萬級。在PCR實驗中所產生的DNA與RNA片段污染是一直以來PCR實驗的重點問題。此類污染主要至上次試驗中所產生的基因片段對下次試驗產生的污染,而且一旦試驗環境中的污染形成后很難處理。因為消毒等傳統方式對于基因污染沒有很良好的效果。所以在PCR實驗室設計中一般將整套實驗室設計為全新風型實驗室,這樣而已通過有效的換氣次數來達到凈化室內污染的作用。而在控制方面也有很多不同之處,因為各單位對PCR實驗的重視程度各有不同,所以在設計上也有不同,主要的控制設計有定送定排式壓力控制系統、變送定排式壓力控制系統變送變排式壓力控制系統。在控制設備方面也有很多區分如壓力無關型控制系統、壓力有關型控制系統。

根據業主要求,本PCR實驗室為三區設計,各區可獨立使用,不設置高效過濾系統等相關要求,根據業主以上要求,我方給出的設計方案為壓力無關型變送變排壓力控制系統。本系統的特點是,設備啟動后可根據實驗室內使用節點調節送風量及排風量來控制各房間狀態,系統說明見下圖

? 每個房間可分別控制,使用時通過房間開關輸出啟動信號,當設備接到啟動信號時設備運行,運行中根據管道壓力反饋決定變頻器大小,房間內送排風量由壓力無關型風量調節閥控制。? 當有多個房間開啟或關閉時,設備更加管道壓力反饋,調節設備變頻器增加或減少送排風量來穩定管道壓力。各房間內壓力又房間內的壓力無關型定風量閥進行控制。

? 當BSC(生物安全柜,B2全排)開啟時BSC專用供風機組運行,BSC-供風機-排風機連鎖運轉。

? 當BSC做變風量調節時,根據房間內壓力變化,BSC專用供風機組前安裝的壓力無關型變風量調節閥根據壓力變化增減送風量,確保房間壓力執行在可控范圍內。

? 當房間不適用時,房間與緩沖間均關閉電動密閉閥,確保房間處在密閉狀態避免布朗運動造成的可能污染風險。

? 房間換氣次數均按照一定凈化標準設計,當室內污染發生時,通過一定時間的換氣處理后,污染問題可以基本解決。? 本系統如果業主需要,可在室內送風口末端加裝高效過濾設備,房間可升級為凈化型實驗室。

? 壓力無關型風閥簡介:壓力無關型風閥的特點是不會根據管道壓力的變化而影響風閥內部的送風量,在一定管道壓力區間內能夠自行調節閥體阻力,來穩定送風量,是高端實驗室必備的關鍵部件,目前此類閥體技術均有國外生產廠家控制,目前國內主用使用的產品有妥思、文丘里、西門子等品牌。

第三篇:PCR實驗室

簡介

Pcr實驗室又叫基因擴增實驗室。PCR是聚合酶鏈式反應(Polymerase Chain Reaction)的簡稱。是一種分子生物學技術,用于放大特定的DNA片段,可看作生物體外的特殊DNA復制。通過DNA基因追蹤系統,能迅速掌握患者體內的病毒含量,其精確度高達納米級別,精確檢測乙肝病毒在患者體內存在的數量、是否復制、是否傳染、傳染性有多強、是否必要服藥、肝功能有否異常改變能及時判斷病人最適合使用哪類抗病毒藥物、判斷藥物療效如何、給臨床治療提供了可靠的檢驗依據

條件

1、必須擁有標準的的PCR熒光實驗室;實時熒光定量PCR技術于1996年由美國Applied Biosystems公司推出 由于該技術不僅實現了PCR從定性到定量的飛躍,而且與常規PCR相比,它 有特異性更強、有效解決PCR污染問題、自動化程度高等特點,目前已得到廣 泛應用。本文試就其定量原理、方法及參照問題作一介紹

2、檢測設備必須符合標準PCR熒光實驗室設置要求;熒光定量PCR儀+實時熒光定量試劑+通用電腦+自動分析軟件,構成PCR-DNA/RNA實時熒光定量檢測系統。

3、必須通過國家臨床檢驗中心的驗收和認證;

4、檢測人員必須通過國家臨檢中心業務培訓并取得合格證書;PCR實驗室內工作人員必須參加由國家衛生部或各省臨床檢驗中心舉辦的臨床基因擴增培訓班,并持證上崗。PCR實驗室通過驗收,實驗室至少必須應有兩個以上持有“臨床基因檢測上崗證”。PCR實驗室必須建立嚴格的實驗室管理制度、建立標準化操作程序(SOP)、建立系列質量管理文件等,確保實驗室日常運行符合國家衛生部的要求,確保檢測結果準確、確保實驗室衛生安全,確保實驗室長期穩定運行

5、必須在無菌無塵環境下進行操作

功能

能夠對患者病情進行科學、準確、實時的掌控,并結合抗HBV與T細胞免疫來打破免疫耐受,阻斷肝病病毒復制的療法、有效的分解肝炎病毒,解決了乙肝病毒易變異、耐藥,病毒復制模板難以治療,人體免疫耐受狀態不易打破等醫學難題,能迅速消除臨床癥狀,而且有效抑制乙肝病毒復制,明顯加快e抗原、抗體的血清轉換速度,殺滅血液及肝細胞內的病毒,為防止再感染提供了長期保護,有效阻斷和逆轉肝纖維化、肝硬化進程。

建立方法

1、建立樣品準備區

這個區域專門用作樣品的準備,在制備和操作用于核酸提取的試劑時應該采取預防措施:⑴PCR產物和帶有要擴增序列的DNA克隆不能在這個房間操作。⑵組織培養物、組織標本和血清樣品都帶進樣品準備間處理,以根據應用的需要提取DNA或RNA。⑶用于樣品處理的工具不能被用作普通分子克隆的工具,也不能用作操作靶序列。⑷DNA樣品應該用有專門的防護或正壓活塞式移液管操作,以防止在吸取樣品時有氣溶膠遺留。⑸大體積樣品應該用單獨包裝的無菌一次性移液管吸取。⑹管子打開前都要簡短離心以減少氣溶膠的產生,而且管子不能用力崩開,這樣會產生氣溶膠。⑺任何時候都應該穿實驗服和帶手套,手套要經常更換,尤其在抽提過程中每一步之間都要更換。實驗服要專門用于樣品準備間,經常清洗。

2、樣品準備和RNA-PCR RNA-PCR的額外步驟需要額外的樣品操作,這樣增加了樣品之間污染的機會。為了避免這一問題,反轉錄一步可以在樣品準備區進行。在RNA-PCR中應用UNG以防止污染的方法也有報道。

3、建立前PCR區。

該去專門用于準備各種反應,這個區域必須保持干凈,而且沒有來自克隆和樣品準備的污染。前PCR區必須要有試劑和準備,特別是專門用于前PCR區的正壓活塞式移液管。

4、PCR實驗室試劑的操作。

⑴所用的所有溶液都應該沒有核酸和(或)核酸酶(DNase和RNase)污染。⑵所有PCR試劑中使用的水都應該是高質量的-新鮮蒸餾的去離子水,用0.22μm過濾的,并且是高壓滅菌。⑶在20℃到25℃貯存的試劑建議加點像疊氮鈉一類的抗微生物劑,在擴增試劑或樣品制備試劑中加入0.025%的疊氮鈉不抑制擴增反應。⑷所用試劑都應該以大體積配制,實驗一下看試劑是否滿意,然后分裝成僅夠一次使用的量進行貯存。⑸所有試劑和樣品準備過程中都要使用一次性滅菌的瓶子和管子。⑹新配制的試劑在用于準備新的標本之前應該加以檢驗。⑺樣品準備和前PCR區所使用的移液管在不使用時都應該小心保存。

5、在前PCR區建立PCR混合物。

⑴可以把即刻可用的“主混合物”溶液配好、分裝并保存在-20℃或4℃,在實驗室只涉及到擴增一種或少數幾種特異序列時這樣做很有用。⑵如果你的實驗室使用多套引物,以致于配制包括所有試劑的單一反應混合物不夠經濟,可以考慮分裝保存夠一天的PCR成分。⑶作為一個規則,應該保存一套陰性、弱陽性和強陽性對照樣品來分析樣品配制和PCR前過程的效率和潔凈程度。而且,你也希望通過使用一個已知的弱陽性樣品來驗證你的樣品緩沖液以證明里面不含擴增抑制物。⑷陰性樣品要與每組樣品同時做,以分析是否存在樣品與樣品之間的污染以及是否存在PCR產物的污染,陰性對照應該包括核酸以外的所有試劑。⑸當做陽性對照時,有兩個理由決定了應該使用最少數量的核酸。⑹由于必須有對照反應,對照模板的特點應該予以考慮。

6、控制污染的方法。

已設計出很有力的酶學方法用來消除一種形式的污染—使用UNG,這一技術能有效地消除由PCR產物引起的污染。另一種控制污染的方法是使用紫外線,這種方法不能完全消除污染問題,但可以將污染降低幾個數量級。

7、后PCR區PCR完成以后,需要分析樣品并解釋數據,應該留出一個專門用于反應后處理樣品的地方。后PCR活動中使用的所用試劑、一次性耗材和儀器都必須是專門用于這一目的,決不能把實驗室這一區域的試劑或儀器用于任何前PCR活動

第四篇:為什么PCR實驗室要三區隔離

為什么PCR實驗室要三區隔離

我們之前碰到過一些客戶,說做PCR實驗總是出現假陽性,明明沒有加模板最后卻擴出了產物。如果這種現象頻頻出現,就要注意一下操作環境了。如果你去百度上搜索“PCR出現假陽性了怎么辦”,下面給出的建議一定會有防止交叉污染這條建議。有人說模板DNA是大分子,溶于去離子水中,怎么會無緣無故跑出來污染環境呢?小編將會一一解釋。

這里涉及一個氣溶膠的概念,氣溶膠是由固體或液體小質點分散并懸浮在氣體介質中形成的膠體分散體系,能在空氣中滯留至少幾個小時。PCR反應過程中不斷進行升溫降溫,液體蒸發又冷凝,PCR管中空氣的部分形成了氣溶膠,攜帶了大量DNA擴增產物(注意1ng擴增產物中可作為模板的DNA片段的數量超過1ng起始模板中可擴增DNA片段數量的幾百萬倍甚至更高。比如人的基因組DNA有30億個bp,要擴增的單拷貝基因片段是300bp,1ng起始模板中可以作為模板DNA片段只占總起始模板DNA總量的千萬分之一)。如果在實驗室打開含PCR擴增產物的管蓋,大量攜帶DNA擴增產物的氣溶膠就會涌出,擴散到空氣中,從而對環境造成污染。雖然在整個空間環境中DNA的含量很低,但是由于理論上只要有1個可做為模板的DNA片段也能PCR擴增成功,這就是為什么在污染環境中陰性對照也能擴增出條帶的原因。

所以在專業的PCR實驗(比如臨床PCR檢驗實驗室)室通常有四區隔離(或至少是三區隔離)的要求。

常見的三區指的是:

1、試劑配制區:PCR反應體系的配制區域。

2、標本處理區:包括擴增模板的制備,也就是我們常常提取DNA的地方;

3、PCR擴增和產物分析區:進行PCR擴增的區域,也是擴增產物進行凝膠電泳分析的區域。

如果將PCR擴增區域和產物分析區再次分開,就是四區隔離了。四區隔離,主要目的是防止氣溶膠在各個PCR區域之間的流動—最好的方法是干脆每個區域隔一幢樓,那肯定是最佳的隔離措施了,但操作起來肯定不現實,于是便有了針對不同區域設置正負壓的方法:

試劑配制區(Ⅰ區):最潔凈的區域,保持微正壓使得外界空氣無法進入隔離污染源。并且陰性模板應該在此區加入PCR管并蓋蓋,嚴禁在此區域打開、存放裝有DNA模板的離心管; DNA模板添加區(Ⅱ區):保持微負壓,保證內部空氣不外泄,以免陽性模板的氣溶膠對外界環境造成污染。擴增及PCR產物分析區(Ⅲ區):保持微負壓,使得內部空氣不外泄,以免擴增產物的氣溶膠對外界環境造成污染。操作時遵循Ⅰ區→Ⅱ區→Ⅲ區單一方向進行,不可逆向進行。

對于科研用途的PCR實驗室,如果無法達到嚴格的三區隔離的要求,至少也要做到兩區隔離:即正壓區和負壓區。正壓區實施Ⅰ區的功能,負壓區實施Ⅱ區,Ⅲ區的功能。

最忌諱也是最可怕的是反過來,在正壓區實施Ⅲ區的功能。我們有個用戶的所有實驗室都是正壓—因為進入實驗室的空氣都是經過過濾的。他信心滿滿地認為他們的實驗室超干凈,做PCR絕對沒問題,但他們實驗室出現了最嚴重的PCR產物污染問題—所有的陰性對照都是陽性。所以PCR實驗室的潔凈度是次要的,不同區域間的空氣是互相之間否有流通才是最關鍵的。

如果有的同學問,我們的實驗室沒有正負壓的區分,或者是全負壓,全正壓怎么辦呢?那我們的建議是:別怕麻煩,找個遠離Ⅲ區(通俗地講就是打開PCR擴增產物的蓋子區域,比如電泳區)的實驗室當做PCR I區使用,能省掉后續更多的麻煩。

既然PCR三區隔離的目的是為了阻斷氣溶膠的交流,請注意以下細節,思考一下氣溶膠來自哪里:

1.每個區域都應配備專用的移液器,不可交叉混用。我們的一位用戶拿電泳室的移液器加模板,陰性對照擴出了很亮的條帶。2.每個區域都應配備專用的移液器吸頭,不可交叉混用。

3.如果條件允許,在PCRⅢ區工作結束后再次進入PCR I區需要更換實驗服、一次性鞋套、帽子、手套。4.在PCR I區、PCRⅡ區配備帶濾芯吸頭。

很多做PCR的同學會將做PCR的吸頭滅菌、或者是在超凈臺做PCR操作。但在小編看來這完全沒有必要,因為做好PCR最重要的是防止擴增產物的污染,而不是無菌操作!試想一下,高壓滅菌了又如何,DNA并不會因此而降解多少,如果細菌的DNA會參與PCR擴增,那么無論活菌或是細菌尸體都一樣能擴增出DNA條帶。

新景實驗室

第五篇:PCR實驗室說明

PCR實驗室設計

PCR實驗室分為四個區域,進入各工作區域必須嚴格按照單一方向進行,不同的工作區域使用不同的工作服(例如不同的顏色)。工作人員離開各工作區域時,不得將工作服帶出,四區域分別為: 1.試劑配制區n 2.樣品處理區n 3.核酸擴增區n 4.產物分析區n 如使用全自動分析儀,區域可適當合并,三四區可合并為擴增產物分析。

各區的功能是: 1.1.1 試劑準備區:擴增試劑的配制、分裝和保存。1.1.2 樣品處理區:樣品登記、分裝;核酸提取、保存和加樣。1.1.3 擴增產物分析區:擴增產物的測定、結果分析、登記及報告。1.2 擴增前區與擴增后區應嚴格分開,須使用不同的房間,兩區之間最好有一定的間隔。1.3 使用商品化試劑盒可在樣品處理區進行少量試劑配制。1.4 在滿足下列操作和清潔處理要求的前提下樣品處理區和試劑準備區可設在同一房間內: 1.4.1 在生物安全柜內操作。1.4.2 每個實驗人員、實驗組分別使用各自的試劑及耗材。1.4.3 盛放污染材料的器皿密封并一次性使用。1.4.4 用有效的方法對操作區域和共享器具在實驗前后進行清潔及消毒。設計要求:

PCR實驗室可以是分散形式,也可以是組合形式,現要主要是以組合形式為主流。完成一組PCR實驗,通常應經過試劑配制、樣品處理、核酸擴增及產物分析四個實驗過程,若實驗工藝需要,還應增加樣品粉碎過程。

一、分散形式PCR實驗室 所謂分散形式PCR實驗室,是指完成上述實驗過程的實驗用房彼此相距較遠,呈分散布置形式。對于這種布置形式的PCR實驗室,由于各個實驗之間不易相互干擾,因此無需特殊條件要求。

二、組合形式PCR實驗室 所謂組合形式PCR實驗室, 是指完成PCR四個實驗過程的實驗用房相鄰布置,組成獨立實驗區域的形式。對于組合形式PCR實驗室,由于各個實驗間集中布置,容易造成相互干擾,因此,對總體布局以及屏障系統具有一定的要求。各室在入口處設緩沖間,以減少室內外空氣交換。

試劑配制室及樣品處理室宜呈微正壓,以防外界含核酸氣溶膠的空氣進入,造成污染,可以通過控制進風風量大于排風風量達到正壓效果。

核酸擴增室及產物分析室應呈微負壓,以防含核酸的氣溶膠擴散出去污染試劑與樣品,可以通過控制排風風量大于進風風量達到負壓效果。

在理想情況下,PCR實驗室緩沖間內,可設置正壓,使室內空氣不流向室外,室外空氣不流向室內。

PCR實驗室進風由原有中央空調控制,要求將中央空調風口安裝到指定定點,且高度為地面鋪裝好后2600mm處。

如果使用熒光PCR儀,擴增室和產物分析室可以合并。

若房間進深允許,可設PCR內部專用走廊。需要指出的是在減少室內外空氣交換方面,緩沖間比專用走廊更有意義。各個區域之間應具備單向的實驗工藝流、物流、人流與氣流,形成單向流程的保護屏障,避免實驗之間的相互干擾,防止核酸氣溶膠對實驗過程造成污染產生假性結果。實驗室的墻體,包括頂棚,應結構牢固、氣密性好;所有陰角宜采用圓弧形線條過渡;墻體內壁光潔、不吸附、耐腐蝕、易清洗消毒;地面材料應滿足無縫隙、無滲漏、光潔、耐腐蝕的要求。

如果使用熒光PCR儀,擴增室和產物分析室可以合并。

若房間進深允許,可設PCR內部專用走廊。需要指出的是在減少室內外空氣交換方面,緩沖間比專用走廊更有意義。各個區域之間應具備單向的實驗工藝流、物流、人流與氣流,形成單向流程的保護屏障,避免實驗之間的相互干擾,防止核酸氣溶膠對實驗過程造成污染產生假性結果。實驗室的墻體,包括頂棚,應結構牢固、氣密性好;所有陰角宜采用圓弧形線條過渡;墻體內壁光潔、不吸附、耐腐蝕、易清洗消毒;地面材料應滿足無縫隙、無滲漏、光潔、耐腐蝕的要求。主要設備試劑準備區 儀器設備主要有冰箱、超凈臺、加樣器、混勻器、天平和離心機等,加樣器、天平除了要專用外,還應有定期校準。試劑分裝應在超凈臺中進行 擴增反應混合液應使用分子生物學級的,試劑制備好后應有質檢:一是否有污染、二是檢測試劑的擴增效果。標本制備區 儀器設備主要有生物安全柜、加樣器、離心機、溫育儀、混勻器等

擴增區 擴增區的主要儀器是核酸擴增儀、超凈臺、微量加樣器、離心機、可移動紫外燈。擴增儀需進行校準。并配備UPS電源,以防止由于電壓的波動,停電對擴增效果的影響。分析區 本區所使用的儀器設備有酶標儀、洗板機、加樣器和水浴箱等

潔凈實驗區的緩沖間部分面積不能超過主實驗室的八分之一,這是有規定的.1、主體結構: 主體為彩鋼板、鋁合金型材。室內所有陰角、陽角均采用鋁合金50內圓角鋁,從而解決容易污染、積塵、不易清掃等問題。結構牢固,線條簡明,美觀大方,密封性好。

2、標準的四區分隔和氣壓調節: 將PCR過程分成試劑準備、標本制備和PCR擴增,產物分析四個獨立的實驗區。整個區域有一個整體緩沖走廊。每個獨立實驗區設置有緩沖區,同時各區通過氣壓調節,使整個PCR實驗過程中試劑和標本免受氣溶膠的污染并降低擴增產物對人員和環境的污染??纱蜷_緩沖區Ⅰ,緩沖區Ⅱ和 PCR 擴增區的排風扇往外排氣,在實驗區的外墻上和各扇門上都安裝有風量可調的回風口,空氣通過回風口向室內換氣。

3、消毒: 在三個實驗區和三個緩沖區頂部以及傳送窗內部安裝有紫外燈,供消毒用。在試劑準備區和標本制備區 還設置移動紫外線燈,對實驗桌進行局部消毒。

4、不銹鋼傳遞窗: 試劑和標本通過機械連鎖不銹鋼(不建議使用電子連鎖方式)傳遞窗傳遞,保證試劑和標本在傳遞過程中不受污染(人物分流)。

5、地面 地面建議使用PVC卷材地面或自流坪地面,整體性好。便于進行清掃,耐腐蝕。

6、照明 燈具要選用凈化燈具,能達到便于清洗、不積塵的特點。在建設的過程中應注意: ●規范的安裝流程和全面的服務流程。●嚴格按照規范科學設計的安裝流程。●安裝前需要確定以下安裝條件,如:電源電壓,電源進線位置,電話網絡線進線位置,進水水壓,最小安裝空間,地面平整度,通風孔、進水管和下水管的位置等,理想狀態的空間尺寸 樣本處理區

三、工作區域及設備要求

(一)試劑儲存和準備區 1、2-8C和-15C冰箱

2、混勻器

3、微量加樣器(覆蓋1-1000ul)

4、移動紫外燈(近工作臺面)

5、消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、耐高壓處理的離心管和加樣器吸頭(帶濾心)

6、專用工作服和工作鞋

7、專用辦公用品

(二)標本制備區 1、2-8C冰箱、-20C或-80C冰箱

2、高速臺式冷凍離心機

3、混允器

4、水浴箱或加熱模塊

5、微量加樣器(覆蓋1-1000ul)

6、可移動紫外燈(近工作臺面)

7、生物安全柜

8、消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、耐高壓處理的離心管和加樣器吸頭(帶濾心)

9、專用工作服和工作鞋

10、專用辦公用品 如需處理大分子DNA,應具有超聲波水浴儀。

(三)擴增反應混合物配制和擴增區

1、核酸擴增儀

2、微量加樣器(覆蓋1-1000ul)

3、可移動紫外燈(近工作臺面)

4、消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、耐高壓處理的離心管和加樣器吸頭(帶濾心)

5、專用工作服和工作鞋

6、專用辦公用品(四)擴增產物分析區 視檢驗方法不同而定。基本儀器設備如下:

1、微量加樣器(覆蓋1-1000ul)

2、可移動紫外燈(近工作臺面)

3、消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、加樣器吸頭(帶濾心)

4、專用工作服和工作鞋

5、專用辦公用品 5.人員和樣品的安全是由生物安全柜和定向氣流共同來保證。PCR實驗室設計規程中規定人員和樣品必須單向流動。即從 “試劑準備區到樣品制備區,再從樣品制備走向擴增區和產物分析區”,絕對不能反向流動,以辟免交叉污染。氣流方向只規定試劑準備區為微正壓或常壓,樣品制備區為常壓或負壓,擴增區和產物分析區為負壓,壓力梯度是從試劑準備到產物分析區,是高到低的。規程并沒有規定要做成全新風系統,但是為降低交叉污染的風險,建議做成全新風系統。概述 臨床基因擴增實驗又稱PCR實驗,是專門用來檢驗艾滋病、乙型肝炎、禽疫病等病毒感染性疾病的一種檢測手段。它可以通過將病毒體內所含的基因進行擴增的方法,測出一些病毒含量不高的感染者體內是否含有特定的病毒。由于該檢測方法可以測出普通檢驗難以檢測出的病毒并具有靈敏度高、特異性高、快捷、對樣品要求低等優點,因此被臨床醫生廣為認可,已廣泛應用于醫院的臨床診斷和各防疫檢測部門的禽疫病診斷。但是,這種實驗需要有能保證絕對安全、配置合理的實驗室和非常規范的操作為前提。近年來對臨床基因擴增檢驗實驗室的建設越來越得到重視,因為它對檢測結果的可靠性、準確性和安全性起到至關重要的作用。本文主要從臨床基因擴增檢驗實驗室的平面布局,空調通風系統設計、氣流控制和污染的防制幾個方面對 實驗室設計中的主要特點進行了闡述。臨床基因擴增檢驗實驗室設計的核心問題是如何避免污染。因此,實驗室的平面布局、空調通風系統設計、氣流控制等都是圍繞這個核心問題進行的。下面就對這幾個方面分別進說明。2 PCR實驗室平面布局 臨床基因擴增檢驗實驗室原則上分為四個單獨的工作區域:試劑貯存和準備區、標本制備區、擴增反應混合物配制和擴增區、擴增產物分析區。為避免交叉污染,進入各個工作區域必須嚴格遵循單一方向進行,即只能從試劑貯存和準備區→標本制備區→擴增反應混合物配制和擴增區→擴增產物分析區。各實驗區之間的試劑及樣品傳遞應通過傳遞窗進行。PCR實驗室平面布置示意圖如圖1所示。圖1 PCR實驗室平面布置示意圖 3 實驗室空調通風系統設計及壓力控制 PCR實驗室并沒有嚴格的凈化要求,但是為避免各個實驗區域間交叉污染的可能性,宜采用全送全排的氣流組織形式。同時,要嚴格控制送、排風的比例以保證各實驗區的壓力要求。3.1 試劑貯存和準備區 該實驗區主要進行的操作為貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應混合液的制備。試劑和用于標本制作的材料應直接運送至該區,不得經過其他區域。試劑原材料必須貯存在本區內,并在本區內制備成所需的貯存試劑。對與氣流壓力的控制,本區并沒有嚴格的要求。3.2 標本制備區 該區域主要進行的操作為臨床標本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴增反應管和測定RNA時cDNA的合成。本區的壓力梯度要求為:相對于鄰近區域為正壓,以避免從鄰近區進入本區的氣溶膠污染。另外,由于在加樣操作中可能會發生氣溶膠所致的污染,所以應避免在本區內不必要的走動。3.3 擴增反應混合物配制和擴增區 該區域主要進行的操作為DNA或cDNA擴增。此外,已制備的DNA模板和合成的cDNA(來自樣本制備區)的加入和主反應混合液(來自試劑貯存和制備區)制備成反應混合液等也可在本區內進行。在巢式PCR測定中,通常在第一輪擴增后必須打開反應管,因此巢式擴增有較高的污染危險性,第二次加樣必須在本區內進行。本區的壓力梯度要求為:相對于鄰近區域為負壓,以避免氣溶膠從本區漏出。為避免氣溶膠所致的污染,應盡量減少在本區內的不必要的走動。個別操作如加樣等應在超凈臺內進行。3.4 擴增產物分析區 該區域主要進行的操作為擴增片段的測定。如使用全自動封閉分析儀器檢測,此區域可不設。本區是最主要的擴增產物污染來源,因此對本區的壓力梯度的要求為:相對于鄰近區域為負壓,以避免擴增產物從本區擴散至其它區域。4 污染的預防與控制 PCR實驗室設計的核心問題是如何避免污染。在實際工作中,常見的有以下幾種污染類型:擴增產物的污染;天然基因組DNA的污染;試劑的污染以及標本間的污染。由于一旦發生污染,實驗就必須停止,直到找到污染源為止,而且實驗結果必須作廢,需重新進行實驗。所以發生污染后再圍繞實驗室來尋找污染源不但耗時而且繁瑣,浪費人力物力。因此要避免污染,首先應是預防,而不是排除。4.1 工作區域的嚴格劃分(1)各個實驗區域設置合理;(2)各個實驗區域要有明顯的標記(如醒目的門牌或不同的地面顏色等),以避免各個不同實驗區域設備物品、試劑等發生混淆。4.2 合理的系統設置(1)合理的空調通風系統設置,盡量采用全送全排的空調系統;(2)嚴格的氣流壓力控制,保證不同的實驗區內不同的壓力要求。4.3 規范的操作(1)臨床基因擴增檢驗實驗室的技術人員必須進行上崗培訓,經培訓合格后才能從事臨床基因擴增檢驗的工作;(2)在實驗操作過程中,操作者必須戴手套,并經常更換。此外,操作中使用一次性帽子也是一個有效地防止污染的措施;(3)清潔工作及時、正確。實驗工作結束后,必須立即對本區進行清潔。除常規的消毒液體對表面進行擦拭消毒或紫外線燈的照射消毒外,對一些實驗設備還應進行高壓消毒處理。4.4 嚴格的管理(1)嚴格控制進出實驗室的人員。與實驗無關的人員不得隨意進出實驗室,有條件的情況下要設置獨立的通道和進出整個實驗區的門;(2)在各個實驗區域使用帶有明顯區別標志的工作服(如不同顏色),當工作人員離開時不得將本區的工作服帶至其它區域;(3)盡量減少在實驗區內不必要的走動以減少交叉污染的可能性。(4)擴增產物分析區是最主要的擴增產物污染來源,廢液不能在實驗室中傾倒,必須經消毒液浸泡消毒后在遠離實驗室的地方棄掉,用過的吸頭等一次性材料也應經消毒液浸泡消毒后統一處理,如焚燒等;(5)擴增產物分析區可能會用到某些可致基因突變和有毒物質,應特別注意實驗人員的安全防護。4.5 完備的實驗室配套設施 完備的實驗室配套設施是保證實驗工作的必要條件,應根據各個實驗室實驗內容的不同配備相應的設備和儀器,如超凈工作臺、離心機、加樣器等。

PCR實驗室并沒有嚴格的凈化要求,但是為避免各個實驗區域間交叉污染的可能性,宜采用全送全排的氣流組織形式。同時,要嚴格控制送、排風的比例以保證各實驗區的壓力要求。3.1 試劑貯存和準備區 該實驗區主要進行的操作為貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應混合液的制備。試劑和用于標本制作的材料應直接運送至該區,不得經過其他區域。試劑原材料必須貯存在本區內,并在本區內制備成所需的貯存試劑。對與氣流壓力的控制,本區并沒有嚴格的要求。3.2 標本制備區 該區域主要進行的操作為臨床標本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴增反應管和測定RNA時cDNA的合成。本區的壓力梯度要求為:相對于鄰近區域為正壓,以避免從鄰近區進入本區的氣溶膠污染。另外,由于在加樣操作中可能會發生氣溶膠所致的污染,所以應避免在本區內不必要的走動。3.3 擴增反應混合物配制和擴增區 該區域主要進行的操作為DNA或cDNA擴增。此外,已制備的DNA模板和合成的cDNA(來自樣本制備區)的加入和主反應混合液(來自試劑貯存和制備區)制備成反應混合液等也可在本區內進行。在巢式PCR測定中,通常在第一輪擴增后必須打開反應管,因此巢式擴增有較高的污染危險性,第二次加樣必須在本區內進行。本區的壓力梯度要求為:相對于鄰近區域為負壓,以避免氣溶膠從本區漏出。為避免氣溶膠所致的污染,應盡量減少在本區內的不必要的走動。個別操作如加樣等應在超凈臺內進行。3.4 擴增產物分析區 該區域主要進行的操作為擴增片段的測定。如使用全自動封閉分析儀器檢測,此區域可不設。本區是最主要的擴增產物污染來源,因此對本區的壓力梯度的要求為:相對于鄰近區域為負壓,以避免擴增產物從本區擴散至其它區域。4.0傳遞窗口的尺寸:

普通傳遞窗規格: SAT500 500x500x500(工作尺寸)SAT600 600x600x600(工作尺寸)潔凈傳遞窗規格: SAT600 600x600x600(工作尺寸)SAT1000 600x1000x600(工作尺寸)

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